向R

时间:2019-05-14 14:40:09

标签: r statistics modeling

我正在使用R中的marked包来模拟人群的年间生存率变异性。通过测试几个模型(比较AIC值),我获得了phi(表观生存参数)和p(捕获/检测概率)。

这是我的数据(类data.frame)的样子:

        ch   Sex   SVL WT1 WT2 WT3 WT4 WT5 WT6 WT7
1    0100000   M 57.10 -15 -16 -21 -26 -16 -14 -21
2    0100000   F 59.43 -15 -16 -21 -26 -16 -14 -21
3    0100000   F 67.57 -15 -16 -21 -26 -16 -14 -21
4    0100000   F 65.10 -15 -16 -21 -26 -16 -14 -21

其中WT1,WT2等是每年的最低冬季温度,而ch是多年来的捕获历史(0 =缺席,1 =存在)。

目标是获得模型Phi(WT)p(t)。 我继续这段代码:

data.proc <- process.data(data.full, model = 'cjs', begin.time = 1)
data.ddl <- make.design.data(data.proc)

# capture-recapture model fitting (crm):
mod.Phit.pt <- crm(data.proc, data.ddl, 
                   model.parameters=list(Phi=list(formula=~time),
                   p=list(formula=~time)),method="Nelder- 
                   Mead",hessian=T)

这可行,渲染模型Phi(t)p(t)

mod.Phit.WT <- crm(data.proc, data.ddl, 
model.parameters=list(Phi=list(formula=~WT)), 
p=list(formula=~time))

这不起作用,导致错误:

  

crm中的错误(data.proc,data.ddl,model.parameters = list(Phi =   列表(公式=〜WT)):     参数4匹配多个形式参数

我应该使用其他格式的时变协变量WT吗?

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