如何绘制带有反变换(实际)值的graphviz决策树?

时间:2019-05-12 14:26:59

标签: python scikit-learn graphviz zscaler inverse-transform

我正在使用graphviz绘制分类决策树。

在适应这些功能之前,我使用“ preprocessing.StandardScaler()”来缩放它们

因此,当我绘制决策树时,我会基于“转换后的值”对其进行绘制

有没有一种方法可以在对分类器进行绘制之前对其进行“逆变换”,以便决策树在节点上而不是在转换后的节点上绘制实际值?

是的,我已经尝试过scale.inverse_transform(rf_clf)....但当然不要烦恼...

从sklearn.datasets导入数据集

iris = datasets.load_iris()

从字典创建数据框

species = [iris.target_names[x] for x in iris.target]
iris = pd.DataFrame(iris['data'], columns = ['Sepal_Length', 'Sepal_Width', 'Petal_Length', 'Petal_Width'])
iris['Species'] = species

转换为数组

Features = np.array(iris[['Sepal_Length', 'Sepal_Width', 'Petal_Length', 'Petal_Width']])

levels = {'setosa':0, 'versicolor':1, 'virginica':2}
Labels =  np.array([levels[x] for x in iris['Species']])

分裂

nr.seed(1115)
indx = range(Features.shape[0])
indx = ms.train_test_split(indx, test_size = 100)
X_train = Features[indx[0],:]
y_train = np.ravel(Labels[indx[0]])
X_test = Features[indx[1],:]
y_test = np.ravel(Labels[indx[1]])

缩放比例:

scale = preprocessing.StandardScaler()
scale.fit(X_train)
X_train = scale.transform(X_train)

适合分类器

rf_clf = tree.DecisionTreeClassifier() ###simple TREE
rf_clf.fit(X_train, y_train)*

使用graphviz绘制决策树:

dot_data = tree.export_graphviz(rf_clf, out_file=None, 

             feature_names=['Sepal_Length', 'Sepal_Width', 'Petal_Length', 'Petal_Width'], 
             class_names=['setosa', 'versicolor', 'virginica'], 

                 filled=True, rounded=True,  
                 special_characters=True)

print(dot_data)

graph = graphviz.Source(dot_data)  
graph 

第一个节点的结果为“ Petal_width <= 0.53”,第二个节点的结果为“花瓣长度<= -0.788”,它是真实数量的负数。

我希望树的实际值以英寸为单位...

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您可以遍历树并自行设置节点阈值。

如果您考虑以下遍历树的示例:https://scikit-learn.org/stable/auto_examples/tree/plot_unveil_tree_structure.html#sphx-glr-auto-examples-tree-plot-unveil-tree-structure-py

上面写着print("%snode=%s test node: go to node %s if X[:, %s] <= %s else to node %s."...的地方 您可以重写阈值,并对测试的功能使用缩放器的inverse_transform函数。

transformed = np.empty(X_train.shape[1])
transformed[:] = np.nan
transformed[feature[i]] = threshold[i]
threshold[i] = scale.inverse_transform(transformed)[feature[i]]

您生成的点文件将包含更新的值。不过,您将无法再使用带有缩放功能的树进行预测。

注意:阈值的值与不进行缩放时不完全相同,我不确定缩放器是否会对阈值产生这样的影响。