将HTML / XML PDF文件格式读入R

时间:2019-05-10 19:05:27

标签: html r xml

我试图通过将pdf读取为HTML / XML文件来解析pdf。我知道我可以使用pdftools包来阅读它。但是,如果我仅以HTML / XML文件的形式读取链接,则无法访问其中的数据。

library(xml2)
library(XML)
html_string="https://mchb.hrsa.gov/whusa11/hstat/hsrmh/downloads/pdf/233ml.pdf"
ht <-read_html(html_string)
nodes<-xml_find_all(ht, ".//body")


> ht
{xml_document}
<html>
 [1] <body><p>%PDF-1.6\r%\xe2ãÏÓ\r\n83 0 obj\r&lt;&gt;stream\r\nhÞ\u009cTË\u008eÓ@äSú'»çÑ3\u0096V+EA\\"V«$·\u ...
 [2] <html><p>\u009d@a ö¯\u0088Î÷Ü\\&amp;ÔÈýÐâÿZO^"j[FoQ)ÒÇq\n\u009b\u008dx\u0085\u008eß±µ\u009bõo\t­\u008f6¢ ...

> ht[1]
  $node
  <pointer: 0x00000000047901a0>

我也尝试了以下功能

xmlTreeParse
xmlToList
xmlParse

如何访问其中的xml文档内容字符串?我正在努力使它们成为我可以操纵的对象。

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

使用pdfx

的可能解决方案
# download file to your home dir
download.file("https://mchb.hrsa.gov/whusa11/hstat/hsrmh/downloads/pdf/233ml.pdf","233ml.pdf")

# get packages
library(remotes)
remotes::install_github("sckott/extractr")
library(extractr)

#parse
pdfx(file="233ml.pdf", what="parsed")

答案 1 :(得分:2)

您的xml_document ht包括1x正文和13x html 您可以使用html_node中的html_nodesrvest提取所需的片段。

library(xml2)
library(XML)
library(rvest)
library(dplyr)

html_string="https://mchb.hrsa.gov/whusa11/hstat/hsrmh/downloads/pdf/233ml.pdf"
ht <-read_html(html_string)

ht %>% html_nodes("html") # look at all html nodes
ht %>% html_node("body") # look at body node 

根据您的问题,您似乎希望将正文节点作为文本,对吗?

您可以通过以下方式获得它:

ht %>% html_node("body") %>% as.character -> text #get body node as text
text    
[1] "<body><p>%PDF-1.6\r%\xe2ãÏÓ\r\n83 0 obj\r&lt;&g...