Question

是否有一种方法可以使用文件对象（二进制流）或者从netCDF4数据集对象创建（打开/加载）虹膜多维数据集？

具体来说，我有一个通过URL提供的文件，但不是由OpenDAP服务器提供的； iris.load_cube()和朋友对此失败。

我意识到Iris更喜欢延迟加载，因此使用URI而不是内存中的数据，但这并不总是可行的。

对于普通的netCDF4 Dataset对象，我可以执行以下操作：

from urllib.request import urlopen
import netCDF4 as nc

url = 'https://crudata.uea.ac.uk/cru/data/temperature/HadCRUT.4.6.0.0.median.nc'
with urlopen(url) as stream:
    ds = nc.Dataset('HadCRUT', memory=stream.read())

因此，我希望对Iris Cube做类似的事情，或者将netCDF4数据集读入多维数据集，而无需通过磁盘上的临时文件。我曾希望Iris功能中可以有一些东西，但是我（尚未）无法在参考文档中找到它。

Answer 1

要读取.nc文件，Iris在内部使用了您提到的same netcdf4-python库。

这意味着从理论上讲您可以：

子类CFReader覆盖了__init__方法，唯一的变化是行self._dataset = netCDF4.Dataset(self._filename, mode='r')
要么编写将使用自定义CFReader的load_cube函数（based on this code），要么可以使用自定义CFReader进行iris的补丁。
li>

猴子修补的一般想法：

from urllib.request import urlopen

import iris.fileformats.cf
import netCDF4 as nc


def __patch_CFReader():
    if getattr(iris.fileformats.cf.CFReader, '_HACKY_PATCHED'):
        return

    from iris.fileformats.cf import CFReader

    class CustomCFReader(CFReader):
        _HACKY_PATCHED = True

        def __init__(self, uri, *args, **kwargs):
            # ... other code copied
            with urlopen(url) as stream:
                self._dataset = nc.Dataset('HadCRUT', memory=stream.read())
            # ... other code copied

    iris.fileformats.cf.CFReader = CustomCFReader


__patch_CFReader()

import iris
cube = iris.load_cube('https://crudata.uea.ac.uk/cru/data/temperature/HadCRUT.4.6.0.0.median.nc')

警告！根据项目中导入的方式，猴子修补可能会并非总是像您首先想到的那样工作。所以也许您应该更喜欢使用一些图书馆专为猴子修补设计的大猩猩：

https://gorilla.readthedocs.io/en/latest/tutorial.html

# my_patches.py:
from urllib.request import urlopen

import gorilla
import iris.fileformats.cf
import netCDF4 as nc

settings = gorilla.Settings(allow_hit=True)

@gorilla.patch(iris.fileformats.cf.CFReader, settings=settings)
def __init__(self, uri, *args, **kwargs):
    # ... other code copied
    with urlopen(url) as stream:
        self._dataset = nc.Dataset('HadCRUT', memory=stream.read())
    # ... other code copied

# earliest_imported_module.py:
import gorilla
import my_patches

for patch in gorilla.find_patches([my_patches]):
    gorilla.apply(patch)

从文件对象或netCDF4数据集创建虹膜多维数据集

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