Question

我试图根据表中几行中的列值多次打印字符“ N”

例如，此表的输出：

AATTGGCC   A   1.7   4
CCGGTTAA   T   0.8   3
AAGGTTCC   G   2.4   7

理想情况下会返回：

NNNN
NNN
NNNNNNN

基于第4列中的值。

当前，我一直在使用：

while read line
do
a=$4
printf "$0.sN\n" {a}
done < table.txt

但是这只会返回三个'N'，每个在换行符上。理想情况下，我还要在输出的每一行末尾打印第2列中的字母。

有人可以帮助我吗？

Answer 1

使用bash：

while read x x x end; do
  for ((i=0; i<$end; i++)); do
    echo -n "N"
  done
  echo
done < file

输出：

NNNN
NNN
NNNNNNN

Answer 2

以您提供的示例为基础，我将其更改为：

while read line
do
    a=$(echo ${line} | awk '{print $4}')
    printf "N%.0s" $(seq $a)
    echo
done < table.txt

我不清楚您如何从原始解决方案中获得3 N（我无法复制），但是也许我们有不同的配置。我上面发布的解决方案基于BASH。在while循环中，第一行代码

    a=$(echo ${line} | awk '{print $4}')

回声一行，然后将其通过管道传递到awk语句中，该语句仅查看第四列并将其保存到名为“ a”的变量中。 $(...)符号只是意味着将括号内的语句作为BASH命令（在这种情况下，将echo传递到awk命令中）进行评估。在第二行，

    printf "N%.0s" $(seq $a)

我通过printf命令打印出$ Ns。 $(...)再次简单地运行BASH命令，在这种情况下，它是seq命令，用于打印$ a字符。使用此脚本，我可以为您的示例table.txt文件获得以下结果：

NNNN
NNN
NNNNNNN