如何为scipy.ndimage.label的功能指定周期性连接?

时间:2019-05-02 13:15:46

标签: python scipy ndimage

给定一个N * N的0和1数组,我想构建聚类列表(一个聚类是一组用1标记的连接点)。

scipy.ndimage.label非常有用,因为它会告诉您哪些点已连接。

但是我还希望在数组上具有周期性边界条件,即,标识点(0,j)(N,j)(就像我粘合成圆柱的平面一样)。因此,我需要告诉scipy.ndimage.label这些要素是通过边界连接的。

例如,如果我的原始数组是:

In[187]: a = [[1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1],[1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1],[1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1]] 

labels = measurements.label(a)
print(labels)
Out [187]: (array([[1, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 2],
   [1, 1, 0, 3, 0, 0, 2, 2],
   [1, 1, 0, 0, 0, 2, 2, 2]], dtype=int32), 3)

我想:

(array([[1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1],
   [1, 1, 0, 3, 0, 0, 1, 1],
   [1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1]], dtype=int32), 2)

label的structure参数允许指定连接(例如,即使它们沿对角线接触也已连接的特征),是否也可以用于此目的?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

这里是在左右边界上施加周期性边界条件的示例。右侧的每个标签都用左侧的相应标签标识(如果存在)。

for y in range(label_image.shape[0]):
    if label_image[y, 0] > 0 and label_image[y, -1] > 0:
        label_image[label_image == label_image[y, -1]] = label_image[y, 0]

您可以对上下边界执行类似的操作。您还可以提出任何其他边界条件,对for循环中的边界像素进行迭代,并以类似的方式在if语句中检查条件。