Question

我想将总和和行总计添加到我的热图，并在已经建议的实现方法中挣扎，例如：ggplot2: Independent Continuous Fill for Summary Row & Column。

以上文章的问题是，我不了解创建总计（行，列）的代码。尽管它被标记为“＃创建摘要行和列”，但我没有。

因此，如果... 1. ...某人可以帮助我，并向我展示一种（简单的）方法以参考我发布的代码（下文），以及 2. ...如果行和列的总计可以具有单独的色标。

我尝试过了...

# create sample
scen <- 1:32
ls <- rep(1:7, length(scen))
df <- data.frame(Landscape = ls, Scenario = scen)
df$SoP <- sample(seq(-0.070, 0.070, by = 0.01),replace=T, nrow(df))
df$Landscape_Name <- LETTERS[1:7]

# create heatmap
library(ggplot2)
df.diff <- ggplot(df, aes(x = Landscape_Name, y = Scenario)) +
  geom_tile(aes(fill = SoP)) +
  geom_text(size = 3, aes(label = round(SoP,2))) + #displays cell values
  scale_fill_gradient2(low = "gold", #colors
                       mid = "white",
                       high = "grey",
                       midpoint = 0) +
  theme(panel.grid.major.x=element_blank(), #no gridlines
        panel.grid.minor.x=element_blank(), 
        panel.grid.major.y=element_blank(), 
        panel.grid.minor.y=element_blank(),
        panel.background=element_rect(fill="white"),
        axis.text.x = element_text(angle=0, hjust = 0.5,vjust=0.5, size = 8,face = NULL),
        axis.text.y = element_text(size = 8,face = NULL),
        plot.title = element_text(size=10,face="bold")) +
  ggtitle("Treatment efficiency") + 
  theme(legend.title=element_text(face="bold", size=8)) + 
  scale_x_discrete(name="Landscape", position = "top") +
  scale_y_discrete(name="Scenario") +
  labs(fill="SoP")
print(df.diff)

非常感谢您的帮助！

Answer 1

让我们看看我能否在您引用的帖子（即ggplot2: Independent Continuous Fill for Summary Row & Column

中解释答案）

首先要注意的几点：

在y轴上，您正在绘制一个数字矢量，这被认为是一个连续的比例尺，这就是为什么在运行scale_y_discrete时，当标签工作正常时，轴标签消失了的原因，一旦我们决定在轴上添加新值（即Total），就会引起问题，这就是为什么我认为Scenario应该是字符向量的原因。
使用Scenario将列as.character转换为字符串会弄乱值的排序，例如尝试运行sort(as.character(1:20))，可以使用2位数字来避免这种情况（01、02， 03，.....），这就是我在那里做的
在上述答案中，总数与原始df绑定在一起，但是我将它们用作外部数据，以使其更易于理解（或者至少我认为这样更容易）

所以我们开始：

library(ggplot2)
library(dplyr)

# pad numbers with zeros to get 2 digit numbers, this will be a string
scen <- sprintf('%02d', 1:32)
ls <- rep(1:7, length(scen))
df <- data.frame(Landscape = ls, Scenario = scen)
df$SoP <- sample(seq(-0.070, 0.070, by = 0.01),replace=T, nrow(df))
df$Landscape_Name <- LETTERS[1:7]

# create the main plot, and take a look at it
df.diff <- ggplot(df, aes(x = Landscape_Name, y = Scenario)) +
  geom_tile(aes(fill = SoP)) +
  geom_text(size = 3, aes(label = round(SoP,2))) + #displays cell values
  scale_fill_gradient2(low = "gold", #colors
                       mid = "white",
                       high = "grey",
                       midpoint = 0) 

df.diff

现在，我们需要允许我们为Landscape_Name添加一个额外类别和为Scenario添加一个额外类别的数据，例如：

添加到Landscape_Name的类别（水平总和）是每个SoP的所有Scenario的总和，并且
添加到Scenario的类别（垂直总和）是每个SoP的所有Landscape_Name的总和

基本上我们需要group_by和sum

h_total <- df %>% 
  group_by(Scenario) %>% 
  summarise(SoP = sum(SoP)) %>% 
  mutate(Landscape_Name = 'Total')


v_total <- df %>% 
  group_by(Landscape_Name) %>% 
  summarise(SoP = sum(SoP)) %>% 
  mutate(Scenario = 'Total')

现在，我们可以使用geom_point将分组数据添加到原始图中，因为我们在新数据中使用了相同的列名，因此x和y的美感将被继承与原始图不同，并且要使用与原始图不同的配色方案，我们使用color（而不是fill），这种颜色在所选形状下效果很好。

如果还需要总计的单元格值，则也必须为其添加图层

p <- df.diff + 
  geom_point(data = h_total, 
             aes(color = SoP), 
             size = 10, 
             shape = 19) +
  geom_point(data = v_total, 
             aes(color = SoP), 
             size = 10, 
             shape = 19) +
  scale_color_gradient2(low = "red", #colors
                        mid = "white",
                        high = "grey",
                        midpoint = 0) +
  geom_text(data = h_total, size = 3, aes(label = round(SoP,2))) +
  geom_text(data = v_total, size = 3, aes(label = round(SoP,2)))

p

最后添加主题自定义项，标题以及轴和图例标签

p  +
  theme(panel.grid.major.x=element_blank(), #no gridlines
        panel.grid.minor.x=element_blank(), 
        panel.grid.major.y=element_blank(), 
        panel.grid.minor.y=element_blank(),
        panel.background=element_rect(fill="white"),
        axis.text.x = element_text(angle=0, hjust = 0.5,vjust=0.5, size = 8,face = NULL),
        axis.text.y = element_text(size = 8,face = NULL),
        plot.title = element_text(size=10,face="bold"),
        legend.title=element_text(face="bold", size=8))  + 
  scale_x_discrete(name="Landscape", position = "top") +
  scale_y_discrete(name="Scenario", 
                  # if you want the total to be at the bottom instead of at the top, 
                  # you can set the limits of y  with the reversed order of the categories 
                  limits = rev(c(unique(as.character(df$Scenario)), 'Total'))) + 
  # you can here change the y/x ratio 
  coord_fixed(ratio = 0.4) +
  labs(fill="SoP", color ="SoP Total") +
  ggtitle("Treatment efficiency")

我终于用ggsave(' PATH/TO/plot.jpeg', width =20, height = 40, units = 'cm')

保存了剧情

这就是输出

在R中的ggplot热图上添加边际总数

1 个答案: