Question

我正在尝试将UpsetR图中的设置名称标签（使用Upset函数）更改为包含多个单词的字符串。我要设置标签的名称不是“ A”，“ B”，“ C”，而是“ A Description”，“ B Description”，“ C Description”。我不想在单词之间加句号或下划线。

test <- upset(grouped_hot,
sets= c("A Description", "B Description","C Description", "N Description"),
nintersects = 8, 
mb.ratio = c(0.6, 0.4),
sets.x.label = "Number of Patients",
sets.bar.color =  "#56B4E9", 
mainbar.y.label = "Number of Patients",
order.by = "freq", 
empty.intersections = "on", 
keep.order = FALSE,
 scale.sets = "identity", 
att.pos = "top", 
text.scale = c(2.5,2.5,2,1.5,2.5,2.5))

实际结果是我在图像上设置的集被标记为A.Description，B.Description和C.Description。但是，我不需要单词之间的句点，而是需要空格。有什么想法仅出于绘图目的更改“设置名称标签”的名称？谢谢！

Answer 1

我以不同的方式使用翻转功能，但是如果您能够重新格式化/重新排列输入数据，那么它可能会对您有所帮助。

这里：

##make input list
listInput = list(data.list1,
                 data.list2,
                 data.list3)
##rename list
names(listInput) = c("Name 1", "Name 2", "Name 3")

#make diagram
upset(fromList(listInput), order.by = "freq", #input, descending order  
      mainbar.y.label = "Number of common genes", #y axis
      sets.x.label = "Number of genes \nin the dataset", #x axis small plot
      main.bar.color = "black",
      sets.bar.color = "black",
      mainbar.y.max = 10 #y axis adjustment
        )

它读取集合名称为名称1，名称2和名称3。

希望它会有所帮助:) 安娜

图中的UpsetR更改集名称标签

1 个答案: