Question

我正在尝试从Python调用R包中的函数。 R函数需要一个回调函数，该函数需要一个值向量，进行一些计算并返回结果向量。

我能够使回调工作，但前提是它必须返回标量。所有尝试返回多个值的尝试都会导致rpy2抛出ValueError。

在rpy2.robject中，我尝试了FloatVectors和IntVectors。我还尝试过将Python列表转换为numpy数组或pandas数据框，然后使用rpy2的接口进行转换。没有工作。

很明显，我能够成功使用所有这些方法来创建对象，这些对象可以从Python传递到R函数的参数列表。当我尝试从Python回调中返回一个向量时，只会收到错误消息。

我将问题简化为一个简单的测试。这是R代码，它接受然后调用回调函数：

Test <-
function(cb) {
    cb()
}

而且，这是我用来调用R代码的Python代码：

import rpy2.rinterface as ri
from rpy2 import robjects

robjects.r('source("Test.R")')
test = robjects.r['Test']

@ri.rternalize
def cb_test():

    return robjects.FloatVector([1.0, 2.0, 3.0])

test(cb_test)

预期结果：

FloatVector with 3 elements.
1.000000    2.000000    3.000000

实际结果：

<class 'ValueError'>: [1] 1 2 3

在此先感谢任何可以弄清我在做什么的人。

Answer 1

这个问题也可以简单地重现：

import rpy2.rinterface as ri
ri.initr()

@ri.rternalize
def cb_test():
    return ri.FloatSexpVector([1.0, 2.0, 3.0])

cb_test()

这似乎是一个问题，现在在这里进行跟踪：https://bitbucket.org/rpy2/rpy2/issues/538/

编辑：代码存储库中有一个初步修复，而rpy2的错误修复版本通常会在周末发布。

rpy2：如何从Python回调函数将向量返回到R？

1 个答案: