Question

我在R中有这个功能，我想在python中调用它。我计划将已经在python中操作的数据分配给R函数，以对其进行进一步分析。在函数进行分析之后，我还需要将数据返回到python。我知道rpy2，我使用了这个命令

robjects.r('''source('mycode.R')''')
r_test_function = robjects.globalenv['myFunction']

我收到此错误：

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/rinterface/的初始化的.py：186：   RRuntimeWarning：文件错误（文件名，“r”，编码=编码）：
  无法打开连接

warnings.warn（x，RRuntimeWarning）   /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/rinterface/init.py:186：   RRuntimeWarning：另外：warnings.warn（x，RRuntimeWarning）   /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/rinterface/init.py:186：   RRuntimeWarning：警告信息：

warnings.warn（x，RRuntimeWarning）   /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/rinterface/init.py:186：   RRuntimeWarning：在文件中（文件名，“r”，编码=编码）：
  warnings.warn（x，RRuntimeWarning）   /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/rinterface/init.py:186：   RRuntimeWarning：

warnings.warn（x，RRuntimeWarning）   /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/rinterface/init.py:186：   RRuntimeWarning：无法打开文件'mycode.R'：没有这样的文件或   目录

warnings.warn（x，RRuntimeWarning）信息|   ____________________________________________________________________________________________________ |错误|终止有异常状态|错误

我使用sys.path.append('thePath')作为包含该函数的目录。有人可以帮我这个吗？我已经搜索了很多关于这个主题的内容，但在我的案例中找不到任何内容。我上面用rpy2解释了什么呢？

谢谢，

Answer 1

您关心的是获取完整的目录路径吗？我目前正在使用Python 3.6来浏览目录中的所有文件并列出它们。由于您只想使用一个特定文件，因此可以尝试以下操作：

导入os

file = os.path.abspath（＆＃39;＆＃39; F：\ Training.xlsx＆＃39;＆＃39;）所以你的文件变量看起来像是＆＃39; F：\ Training.xlsx＆＃39;

您只需使用变量文件，而不是输入整个目录路径。

希望它有所帮助。

如何在Python中调用R中的函数？

1 个答案: