Question

我当前正在尝试修改FITS文件的标题。更具体地说，我想为其添加新的关键字。我使用的是FitsIO for python，版本为0.9.11。

在进行一些数据处理期间，我的程序创建了新的FITS文件并更新了它们的内容和标题。我曾经使用过Astropy，但是现在这已不再是一种选择，因此我只能使用FitsIO，这对我来说是个挑战。

内容更新/覆盖非常简单，但是我在修改标题时遇到了麻烦。为了隔离我的问题并找到正确的过程（该文档不是很有帮助），我创建了一个小程序，仅测试如何编写标头。

作为输入数据，我使用包含以下内容的FITSHDR对象：

update_data = fitsio.FITSHDR([
"IVAL    =                   36 / integer value           ",
"SHORTS  = 'hello w'                                      ",
"DBL     =                 1.25                           ",
"CDELT1  =                 0.00333333333333               "])

这是经过测试的功能：

def write_hdu_1(data, fits_file):
    with fitsio.FITS(fits_file, 'rw', clobber=True) as fits:
        fits[extension].write_keys(data)

结果：删除END卡，损坏HDU。

def write_hdu_2(data, fits_file):
   with fitsio.FITS(fits_file, 'rw', clobber=True) as fits:
       for key in data.keys():
           fits[extension].write_key(key, data.get(key))

结果：删除END卡，损坏HDU。

def write_hdu_3(fits_file):
    with fitsio.FITS(fits_file, 'rw', clobber=True) as fits:
        keydict = { 'name':'test', 'value':35, 'comment':'keydict test'}
        fits[-1].write_key(**keydict)

结果：

File "test_fitsio.py", line 26, in write_hdu_3
    fits[-1].write_key(**keydict)
TypeError: write_key() got an unexpected keyword argument 'name'

无奈之下，我终于手动添加了“ END”卡，就像这样：

def write_hdu(self, header_content):
    self.fits[extension].write_keys(header_content)
    self.fits[extension].write_key('END', '')

但是，然后，在END卡上填充了空格，这是我正在使用的其他库无法正确识别的。

那么，您对使用python FitsIO添加/更新标头关键字有什么后见之明，而又不会在此过程中丢失“ END”卡？

谢谢！

Answer 1

在打开文件时删除clobber选项，然后将使用标头版本。使用clobber选项可以在打开任何现有文件之前将其删除，请参见docstring和code的实现。

在我这方面，这就像Python3中fitsio 0.9.11的魅力：

with fitsio.FITS('test.fits', 'rw') as ff:
    ff[-1].write_key('KEY', 'key value', 'my comment')

另一方面，如果使用clobber选项，则在现有文件上使用相同代码在给定的HDU标头中附加关键字，从而从磁盘上删除文件。

$ du -sh test.fits                                                                                           
308K    test.fits
$ python3 -c "import fitsio; ff = fitsio.FITS('test.fits', 'rw', clobber=True); ff[-1].write_key('KEY', 'key value', 'my comment')"
$ du -sh test.fits                                                                                  
4.0K    test.fits
$ cat test.fits
KEY     = 'key value'          / my comment                                     END

这是一个很奇怪的结果，但是fitsio附加了END关键字，但是在一个空文件上，如果不是有效的FITS文件，则为空文件。

如何使用FitsIO更新FITS文件头？

1 个答案: