我需要从Wishart分布中采样一个矩阵,其自由度小于比例矩阵的维数。我正在努力寻找允许它的R函数。
对于Wishart分布,自由度(称为df或v)必须大于比例矩阵的维数(例如p)减去1(即 df> p -1 )(请参阅https://en.wikipedia.org/wiki/Wishart_distribution或有关Wishart发行版的任何手册)。但是,当我尝试使用 p-1
假设p = 2,我想从df在1和2之间的Wishart分布(不包括在内)进行采样,但
stats::rWishart(n = 1, df = 1.1, Sigma = diag(2)) # does not work
MCMCpack::rwish(v = 1.1, S = diag(2)) # does not work
不起作用。
我认为问题可能出在非整数自由度上,但是
stats::rWishart(n = 1, df = 2.1, Sigma = diag(2))
MCMCpack::rwish(v = 2.1, S = diag(2))
工作没问题。
我确实找到了
rWishart::rWishart(1, df = 1.1, Sigma = diag(2)) # works
有效,但如果1.5 = 我想在R中从Wishart分布中采样,该分布的自由度大于p-1但小于p(p-1 rWishart::rWishart(1, df = 1.5, Sigma = diag(2)) # does not works
答案 0 :(得分:0)
据我所知,matrixsampling
是唯一提供这种可能性的软件包(我是它的作者)。
library(matrixsampling)
rwishart(3, nu = 1.1, Sigma = diag(2))
# , , 1
#
# [,1] [,2]
# [1,] 0.7679333 -1.051319
# [2,] -1.0513191 1.439281
#
# , , 2
#
# [,1] [,2]
# [1,] 1.8536154 -0.9059983
# [2,] -0.9059983 0.4449708
#
# , , 3
#
# [,1] [,2]
# [1,] 0.9309460 0.6026472
# [2,] 0.6026472 0.3901232
如果您真的想使用单位矩阵作为比例矩阵Sigma
进行采样,则可以执行以下操作:
matrixsampling:::rwishart_I(3, nu = 1.1, p = 2)
(老实说,我不记得自己做了什么,但这应该更有效)。