Question

我正在尝试使用GridSearchCV作为分类器，以SVC进行交叉验证的递归特征消除（RFECV），如下所示。

我的代码如下。

X = df[my_features]
y = df['gold_standard']

x_train, x_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, random_state=0)

k_fold = StratifiedKFold(n_splits=10, shuffle=True, random_state=0)

clf = SVC(class_weight="balanced")
rfecv = RFECV(estimator=clf, step=1, cv=k_fold, scoring='roc_auc')

param_grid = {'estimator__C': [0.001, 0.01, 0.1, 0.25, 0.5, 0.75, 1.0, 10.0, 100.0, 1000.0],
              'estimator__gamma': [0.001, 0.01, 0.1, 1.0, 2.0, 3.0, 10.0, 100.0, 1000.0],
              'estimator__kernel':('rbf', 'sigmoid', 'poly')
       }

CV_rfc = GridSearchCV(estimator=rfecv, param_grid=param_grid, cv= k_fold, scoring = 'roc_auc', verbose=10)

CV_rfc.fit(x_train, y_train)

但是，我收到一条错误消息：RuntimeError: The classifier does not expose "coef_" or "feature_importances_" attributes

有没有办法解决此错误？如果不是，我可以与feature selection一起使用的其他SVC技术是什么？

很高兴在需要时提供更多详细信息。

Answer 1

要查看更多功能选择实现，请查看：

https://scikit-learn.org/stable/modules/classes.html#module-sklearn.feature_selection

作为示例，在下一个链接中，他们将PCA与k最佳功能选择和svc一起使用。

https://scikit-learn.org/stable/auto_examples/compose/plot_feature_union.html#sphx-glr-auto-examples-compose-plot-feature-union-py

使用的一个示例是，为了更简单起见，可以修改前一个链接：

iris = load_iris()

X, y = iris.data, iris.target

# Maybe some original features where good, too?
selection = SelectKBest()

# Build SVC
svm = SVC(kernel="linear")

# Do grid search over k, n_components and C:

pipeline = Pipeline([("features", selection), ("svm", svm)])

param_grid = dict(features__k=[1, 2],
                  svm__C=[0.1, 1, 10])

grid_search = GridSearchCV(pipeline, param_grid=param_grid, cv=5, verbose=10)
grid_search.fit(X, y)
print(grid_search.best_estimator_)

Answer 2

emmm ...在sklearn 0.19.2中，该问题似乎已解决。我的代码与您的代码相似，但有效：

           svc = SVC(                    
            kernel = 'linear',
            probability = True,
            random_state = 1 ) 
       rfecv = RFECV(
               estimator = svc,
               scoring = 'roc_auc'  
               )

       rfecv.fit(train_values,train_Labels)     
       selecInfo = rfecv.support_                      
       selecIndex = np.where(selecInfo==1)

如何在Sklearn中使用SVC运行RFECV

2 个答案: