是否存在将sklearn的StandardScaler实例链接在一起以独立地按组缩放数据的pythonic方法?也就是说,如果我想独立地找到虹膜数据集的特征;我可以使用以下代码:
from sklearn.datasets import load_iris
data = load_iris()
df = pd.DataFrame(data['data'], columns=data['feature_names'])
df['class'] = data['target']
means = df.groupby('class').mean()
stds = df.groupby('class').std()
df_rescaled = (
(df.drop(['class'], 1) - means.reindex(df['class']).values) /
stds.reindex(df['class']).values)
在这里,我要分别减去平均值和除以每个组的标准偏差。但是,要实现这些手段和stdev有点困难,并且从本质上讲,当我拥有要控制的分类变量时,它会复制StandardScaler
的行为。
是否存在更Python / sklearn友好的方式来实现这种缩放?
答案 0 :(得分:2)
当然,您可以使用任何sklearn
操作并将其应用于groupby
对象。
首先,提供一些便利包装:
import typing
import pandas as pd
class SklearnWrapper:
def __init__(self, transform: typing.Callable):
self.transform = transform
def __call__(self, df):
transformed = self.transform.fit_transform(df.values)
return pd.DataFrame(transformed, columns=df.columns, index=df.index)
这将把您传递给它的任何sklearn
变换应用于一个组。
最后是简单的用法:
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
data = load_iris()
df = pd.DataFrame(data["data"], columns=data["feature_names"])
df["class"] = data["target"]
df_rescaled = (
df.groupby("class")
.apply(SklearnWrapper(StandardScaler()))
.drop("class", axis="columns")
)
编辑:您几乎可以使用SklearnWrapper
做任何事情。
这是对每个组进行转换和反转此操作的示例(例如,不要覆盖转换对象)-每次看到新组时都重新安装该对象(并将其添加到{{1 }})。
我有点复制了list
功能,以便于使用(您可以通过将适当的sklearn's
传递给string
内部方法,将其扩展为所需的任何功能):
_call_with_function
用法(组变换,逆运算并再次应用):
class SklearnWrapper:
def __init__(self, transformation: typing.Callable):
self.transformation = transformation
self._group_transforms = []
# Start with -1 and for each group up the pointer by one
self._pointer = -1
def _call_with_function(self, df: pd.DataFrame, function: str):
# If pointer >= len we are making a new apply, reset _pointer
if self._pointer >= len(self._group_transforms):
self._pointer = -1
self._pointer += 1
return pd.DataFrame(
getattr(self._group_transforms[self._pointer], function)(df.values),
columns=df.columns,
index=df.index,
)
def fit(self, df):
self._group_transforms.append(self.transformation.fit(df.values))
return self
def transform(self, df):
return self._call_with_function(df, "transform")
def fit_transform(self, df):
self.fit(df)
return self.transform(df)
def inverse_transform(self, df):
return self._call_with_function(df, "inverse_transform")
答案 1 :(得分:0)
我更新了@Szymon Maszke 代码:
class SklearnWrapper:
def __init__(self, transformation: typing.Callable):
self.transformation = transformation
self._group_transforms = []
# Start with -1 and for each group up the pointer by one
self._pointer = -1
def _call_with_function(self, df: pd.DataFrame, function: str):
# If pointer >= len we are making a new apply, reset _pointer
if self._pointer == len(self._group_transforms)-1 and function=="inverse_transform":
self._pointer = -1
self._pointer += 1
print(self._pointer)
return pd.DataFrame(
getattr(self._group_transforms[self._pointer], function)(df.values),
columns=df.columns,
index=df.index,
)
def fit(self, df):
scaler = copy(self.transformation)
self._group_transforms.append(scaler.fit(df.values))
return self
def transform(self, df):
return self._call_with_function(df, "transform")
def fit_transform(self, df):
self.fit(df)
return self.transform(df)
def inverse_transform(self, df):
return self._call_with_function(df, "inverse_transform")
StandardScaler()
未正确存储在 _group_transforms
中,因此我创建了一个副本(使用副本库)并将其存储(也许使用 OOP 有更好的方法)。