如何在python中通过cyrest打开cytoscape文件？

Question

我目前正在使用cytoscape，并创建了一些会话文件。 然后，我想在python中访问该文件并以图像的形式获取其结果-我特别想在请求结果时使用某些特定的共享名称对其进行排序，这意味着结果会更改为排序词。谢谢。

Answer 1

有一个python库，可用于在Python中使用CyREST。您应该几乎可以从Python在Cytoscape中完成任何操作。这是手册：https://py2cytoscape.readthedocs.io/en/latest/

这是您要寻找的一些步骤：

• cyclient.session.open（）
• cyclient.network.list（）
• cyclient.view.export（）