如何在熊猫中使用分组模式替换缺失值?

时间:2019-04-07 19:13:37

标签: python pandas missing-data imputation

我遵循this post中的方法将丢失的值替换为组模式,但是遇到“ IndexError:索引超出范围”。

 df['SIC'] = df.groupby('CIK').SIC.apply(lambda x: x.fillna(x.mode()[0]))

我想这可能是因为某些组缺少所有值并且没有模式。有办法解决这个问题吗?谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

mode相当困难,因为实际上并没有商定的处理关系的方法。另外,它通常非常慢。这是一种“快速”的方法。我们将定义一个函数来计算每个组的模式,然后再用map填充缺失值。我们不会遇到缺少组的问题,尽管对于关系,我们可以随意选择排序时首先出现的模式值:

def fast_mode(df, key_cols, value_col):
    """ 
    Calculate a column mode, by group, ignoring null values. 

    Parameters
    ----------
    df : pandas.DataFrame
        DataFrame over which to calcualate the mode. 
    key_cols : list of str
        Columns to groupby for calculation of mode.
    value_col : str
        Column for which to calculate the mode. 

    Return
    ------ 
    pandas.DataFrame
        One row for the mode of value_col per key_cols group. If ties, 
        returns the one which is sorted first. 
    """
    return (df.groupby(key_cols + [value_col]).size() 
              .to_frame('counts').reset_index() 
              .sort_values('counts', ascending=False) 
              .drop_duplicates(subset=key_cols)).drop(columns='counts')

样本数据df

   CIK  SIK
0    C  2.0
1    C  1.0
2    B  NaN
3    B  3.0
4    A  NaN
5    A  3.0
6    C  NaN
7    B  NaN
8    C  1.0
9    A  2.0
10   D  NaN
11   D  NaN
12   D  NaN

代码:

df.loc[df.SIK.isnull(), 'SIK'] = df.CIK.map(fast_mode(df, ['CIK'], 'SIK').set_index('CIK').SIK)

输出df

   CIK  SIK
0    C  2.0
1    C  1.0
2    B  3.0
3    B  3.0
4    A  2.0
5    A  3.0
6    C  1.0
7    B  3.0
8    C  1.0
9    A  2.0
10   D  NaN
11   D  NaN
12   D  NaN