R中的相关网络图

Question

我一直在寻找一个程序包，以产生类似于以下内容的图表，但是一直很简短。有谁知道可以在R中产生类似内容的库？图的节点是数据集中的变量，节点之间的粗细由它们的成对Pearson相关性的绝对值定义。为了简单起见，不显示低于特定阈值的绝对权重。节点的大小取决于节点的连接数。谢谢！

Answer 1

您可以使用示例portquiz.net中所述的ggnet2函数在R中完成此操作。在ggnet2中，可以修改节点及其连接的颜色，大小和标签（尽管 不能做弯曲的边缘，自环或超图） 。它应该相对容易（特别是如果您熟悉ggplot2的话）。

如果您需要更多的交互性（或熟悉vis.js），则可能对另一个答案中建议的visNetwork感兴趣。

Answer 2

如果没有ggplot2，则可以使用igraph软件包，并在此处获得完整的教程：http://kateto.net/networks-r-igraph