有没有办法将位置元组作为属性添加到networkx中的已创建节点?

时间:2019-03-30 00:35:20

标签: python-3.x parsing graph networkx

我正在尝试获取正在放入图中的所有节点的位置。当前的目标是创建所有具有xy坐标的节点。

我正在阅读的内容是关于使用add_nodes_from()时的属性,并可能为我的节点创建位置属性。对我来说,阅读一些文档和另一个StackOverflow并不成功。

ex.txt文件:

a2a 5 0
##start
a0 1 2
##end
a1 9 2
3 5 4

python文件:

import re
import pandas as pd
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

def file_parsing(file_path):
    cnt = 0
    output_list = []

    with open(file_path, 'r') as fp:
        for line in fp:
            cnt += 1
            #checks for the room name and coordinates
            if re.match('([^\s#]{1,10}) (\d+) (\d+)', line, re.MULTILINE):
                output_list.append(line.strip().split(' '))
            #checks for start
            if line.startswith('##start'):
                output_list.append(next(fp, '').strip().split())
            #checks for start
            if line.startswith('##end'):
                output_list.append(next(fp, '').strip().split())
    room_name = [item[0] for item in output_list]
    x_coord = [int(item[1]) for item in output_list]
    y_coord = [int(item[2]) for item in output_list]
    x_y = list(zip(x_coord, y_coord))
    return (room_name, output_list, x_y)

rooms, room_coords, xpos_ypos = file_parsing('ex.txt')
print("Room information: ", room_coords)
print("X and Y position as tuple list: ", xpos_ypos)
DG = nx.DiGraph()
DG.add_nodes_from(rooms, pos = xpos_ypos)
pos = nx.get_node_attributes(DG, 'pos')
print(pos)

plt.figure()

nx.draw_networkx(DG)

如您所见,我的xpos_ypos放在一个拉链中,该拉链创建一个元组列表。而且我的迭代顺序很重要,因为第一个房间将从第一个元组开始具有x和y坐标。

例如,我的第一个房间是a2a,坐标为(5, 0)。如果a0,房间(1, 2)将具有坐标。现在,如果要一遍又一遍地为每个房间做同样的事情:如何将房间坐标属性添加到每个房间?就我而言,我得到的是字典:

{'a2a': [(5, 0), (1, 2), (9, 2), (5, 4)], 'a0': [(5, 0), (1, 2), (9, 2), (5, 4)], 'a1': [(5, 0), (1, 2), (9, 2), (5, 4)], '3': [(5, 0), (1, 2), (9, 2), (5, 4)]}

,这是输出draw_networkx(DG)digraph

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您的代码不起作用,因为您传递的位置不正确。 我对您的函数进行了一些更改,以便它返回一个字典,字典以键作为节点名,值作为[x, y]坐标。像这样

{'a2a': (5, 0), 'a0': (1, 2), 'a1': (9, 2), '3': (5, 4)}

然后,我从返回的字典和上面的字典创建图形到pos函数的nx.draw_networkx属性。

import re
import pandas as pd
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
def file_parsing(file_path):
    cnt = 0
    output_list = []

    with open(file_path, 'r') as fp:
        for line in fp:
            cnt += 1
            #checks for the room name and coordinates
            if re.match('([^\s#]{1,10}) (\d+) (\d+)', line, re.MULTILINE):
                output_list.append(line.strip().split(' '))
            #checks for start
            if line.startswith('##start'):
                output_list.append(next(fp, '').strip().split())
            #checks for start
            if line.startswith('##end'):
                output_list.append(next(fp, '').strip().split())
    room_name = [item[0] for item in output_list]
    x_coord = [int(item[1]) for item in output_list]
    y_coord = [int(item[2]) for item in output_list]
    x_y = list(zip(x_coord, y_coord))

    #--------------Changes start from here -----------#

    pos_dict = dict(zip(room_name, x_y))
    return pos_dict

room_pos_dict = file_parsing('ex.txt')
G = nx.Graph()
G.add_nodes_from(room_pos_dict.keys())
nx.set_node_attributes(G, room_pos_dict, 'pos')
nx.draw_networkx(G, pos=nx.get_node_attributes(G, 'pos'))

enter image description here