在Mac的终端机中运行Homer Motif分析的运行命令的疑难解答

时间:2019-03-27 06:37:21

标签: analysis

在Mac的Homer中进行主题分析时出现此错误:-

  

“ bash:findMotifs.pl:找不到命令”

我已按照以下步骤操作:

  • 我创建了一个名为Homer的文件夹,其中保存了ConfigureHomer.pl脚本
  • 然后我通过终端中的cd homer命令进入了homer目录
  • 然后我通过以下命令安装homer:pearl/ConfigureHomer.pl-install 然后我设定路径 为PATH=$PATH:/my_directory/homer/.//bin/
  • 然后,我将鼠标启动器安装为:perl /my _directory/homer/.//configureHomer.pl -install mouse perl /my _directory/homer/.//configureHomer.pl -install mouse-o
  • 然后我将鼠标基因组版本mm10安装为: perl /my _directory/homer/.//configureHomer.pl -install mm10
  • 然后输入以下命令检查其是否工作正常: findMotifs.pl

但是我得到的错误是:

  

bash:findMotifs.pl:找不到命令

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