fpc :: dbscan和dbscan :: dbscan

Question

我想在某些GPS坐标上在R中实现DBSCAN。我有一个距离矩阵（dist_matrix），可以输入以下函数：

dbscan :: dbscan（dis_matrix，eps = 50，minPts = 5，borderPoints = TRUE） fpc :: dbscan（dis_matrix，eps = 50，MinPts = 5，method =“ dist”）

和Im在簇的数量以及一个点是一个噪声点还是属于一个簇方面，从这两个函数得到的结果截然不同。基本上，两种算法的结果不一致。我不知道他们为什么会产生这些截然不同的结果，尽管在这里 http://www.sthda.com/english/wiki/wiki.php?id_contents=7940 我们看到虹膜数据，两个功能都做同样的事情。

我的距离矩阵[来自一个函数（geosphere :: distm），该函数计算超过2000个坐标之间的空间距离。

此外，我根据此伪代码对dbscan进行了编码 来源：https://cse.buffalo.edu/~jing/cse601/fa13/materials/clustering_density.pdf 我的结果等于从fpc包中获得的结果。 谁能注意到他们为什么与众不同。我已经研究了这两个功能，但没有发现任何东西。

Answer 1

geosphere::distm的文档说它不返回dist对象，而是返回一个矩阵。 dbscan::dbscan假设您具有数据矩阵而不是距离。首先使用dist将矩阵转换为as.dist对象。这应该可以解决问题。