当我的RMD文件位于共享驱动器上时,我无法呈现Markdown文件。我正在使用rmarkdown版本1.12,R版本3.5.3、64位Windows 10,pandoc 2.7.1。
我无法呈现为html,pdf或word文档。
此操作失败(文件夹路径中没有空格或标点符号):
rmarkdown::render("//cor.local/subfolders/Martin/aNewRMD.RMD")
但这成功了:
rmarkdown::render("C:/Users/AM4337/Documents/aNewRMD.RMD")
(我只是使用RStudio打开的默认新.RMD文件)。
错误消息:
processing file: aNewRMD.RMD
|......... | 14%
ordinary text without R code
|................... | 29%
label: setup (with options)
List of 1
$ include: logi FALSE
|............................ | 43%
ordinary text without R code
|..................................... | 57%
label: cars
|.............................................. | 71%
ordinary text without R code
|........................................................ | 86%
label: pressure (with options)
List of 1
$ echo: logi FALSE
|.................................................................| 100%
ordinary text without R code
output file: aNewRMD.knit.md
"C:/Pandoc/pandoc" +RTS -K512m -RTS aNewRMD.utf8.md --to html4 --from markdown+autolink_bare_uris+ascii_identifiers+tex_math_single_backslash+smart --output aNewRMD.html --email-obfuscation none --self-contained --standalone --section-divs --template "C:\Users\AM4337\Documents\R\win-library\3.5\rmarkdown\rmd\h\default.html" --no-highlight --variable highlightjs=1 --variable "theme:bootstrap" --include-in-header "C:\Users\AM4337\AppData\Local\Temp\RtmpGoqMWG\rmarkdown-str421411883120.html" --mathjax --variable "mathjax-url:https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML"
pandoc.exe: aNewRMD.utf8.md: openBinaryFile: does not exist (No such file or directory)
Error: pandoc document conversion failed with error 1
答案 0 :(得分:1)
我相信R还不知道如何为网络共享使用任意URI。尽管我猜测某些功能(和其他软件包)可能支持其他方案,但download.file
帮助页面上说
The function 'download.file' can be used to download a single file
as described by 'url' from the internet and store it in
'destfile'. The 'url' must start with a scheme such as 'http://',
'https://', 'ftp://' or 'file://'.
您对"//cor.local/subfolders/Martin/aNewRMD.RMD"
所做的工作是告诉它与名为cor.local
的主机使用Windows文件共享协议(smb,cif等)(以某种方式进行身份验证)并导航至相应的子目录,目录。
我的建议:让Windows提前处理基本身份验证,然后“挂载”它,以便本地计算机上的每个应用程序都将其视为“本地”,但将其安装到驱动器号上:
C:\Users\AM4337> net use /user:yourdomain\youruser g: \\cor.local\subfolders
(它会要求您输入密码),然后在本地使用/ p
R> rmarkdown::render("G:/Martin/aNewRMD.RMD")
答案 1 :(得分:0)
在组织升级到Windows 10后,多个用户试图运行现有的R进程时遇到了相同的问题:“错误:pandoc文档转换失败,错误为1”。
将项目文件夹更改为RStudio项目即可解决此问题。 RStudio项目使用每个用户的本地路径设置其自己的工作目录,因此将网络路径替换为带字母的本地路径。感谢@ r2evans解释了此问题并启用了此解决方法。
(对单独的答案表示歉意,我不敢评论@ r2evans的答案。)