和弦图与Holoviews(很多问题)

时间:2019-03-14 00:12:02

标签: python pandas jupyter-notebook bokeh holoviews

因此,我尝试使用holoviews和bokeh构建和弦图,并遇到一些问题。我发现一些相关的帖子,但并没有太大帮助。本质上,我需要在最后纠正错误时需要帮助,以便可以看到带有标签和颜色的新和弦图(chord.opts)。

基本上,我有一个名称列表(及其各自的业务部门)以及在程序中与之配对的人员。我想用和弦图来形象化每个人的联系。

完全公开:以下代码可能是完全错误的...但这是我在查看示例后想到的。

import holoviews as hv
from holoviews import opts, dim
import pandas as pd
import numpy as np
from bokeh.plotting import figure, output_file, show
from bokeh.io import output_notebook
output_notebook()

hv.extension('bokeh')
hv.output(size=200)

book1 = "../desktop/book3.xls"
pairs = pd.read_excel (book1)

pair_counts = pairs.groupby(['id1', 'id2']).name2.count().reset_index()

pair_counts看起来像这样: pair_counts

test = hv.Chord(pair_counts)

hv.save(test,'test.png')

这将输出以下图片。 test.png

nodes = hv.Dataset(pairs, 'id1', 'bu1')
nodes.data.head()


test2 = hv.Chord((test, nodes)).select(value=(5, None))

此行之后,出现以下错误:

DataError: None of the available storage backends were able to support the supplied data format.

继续...

test2.opts(
    opts.Chord(cmap='Category20', edge_cmap='Category20', edge_color=dim('bu2').str(), 
               labels='bu1', node_color=dim('bu1').str()))

hv.save(test2,'test2.png')

这是excel数据的样子: excel data

这是df“ pairs”中excel数据的dtype:

pairs.dtypes

id1       int64
name1    object
dept1    object
bu1      object
id2       int64
name2    object
dept2    object
bu2      object
dtype: object

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