如何使用read.big.matrix在R中读取多个文件？

Question

我有一个庞大的数据集，其中包含数百个文件，我需要使用bigmemory（或类似的）程序包来读取数据。如何将read.big.matrix与多个文件一起使用？

Answer 1

可能可以从工作目录中迭代地加载文件，然后合并矩阵。

setwd(path_to_files)
files <- list.files(path = ".")
number_of_matrices <- length(files)

#For faster computation set number of matrices
my_matrices <- vector("list", length = S)

for (file in 0:length(files)){
  my_matrices[file] <- read.big.matrix(filename=files[file])
}

#Assuming same columns this will merge them to one single:
massive_matrix <- do.call("rbind", my_matrices)

尚未测试代码，但这可能使您了解如何解决该问题？