Rtsne函数仅读取我的数据集的一部分

时间:2019-03-06 13:03:00

标签: r

我对处理高维数据完全陌生。我目前正在尝试在数据集中的R中执行t-SNE。当我运行代码时(请参见下文),Rtsne函数仅读取30x30矩阵。我的数据集是30x72矩阵,包含30个观察值(行)和72个变量(列)。

proclus.tSNE<-Rtsne(mydataset, dims = 2, perplexity=9, verbose=TRUE, max_iter = 5000)

我不确定为什么矩阵的其余部分没有被读取。任何帮助将不胜感激。

mydataset是蛋白质表达值的矩阵。

谢谢!

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