我对处理高维数据完全陌生。我目前正在尝试在数据集中的R中执行t-SNE。当我运行代码时(请参见下文),Rtsne函数仅读取30x30矩阵。我的数据集是30x72矩阵,包含30个观察值(行)和72个变量(列)。
proclus.tSNE<-Rtsne(mydataset, dims = 2, perplexity=9, verbose=TRUE, max_iter = 5000)
我不确定为什么矩阵的其余部分没有被读取。任何帮助将不胜感激。
mydataset
是蛋白质表达值的矩阵。
谢谢!