具有igraph R的数据框的邻接矩阵

Question

我是R和graphs的新手，我正在尝试使用igraph库与社交签名网络一起练习。

我有一个包含三列的数据框（df）。第一个是投票者，第二个是获得投票的用户，第三个是投票（-1或1分别取决于否定票或肯定票）。

> head(df)

     voter        user      vote
1    ludraman     cjcurrie     1
2    blankfaze    olivo       -1
3    gzornenplatz cjcurrie     1
4    orthogonal   olvion       1
5    andrevan     cerviz       1
6    texture      cjcurrie     1

我想用igraph创建一个图，但是首先我需要从df获取邻接矩阵。

我尝试了图书馆SharpshootR

A <- component.adj.matrix(df[, c(1,2)], mu=df[, 1], co=df[, 2], wt=df[, 3])

是否存在使用igraph库获取邻接矩阵的简单方法？

谢谢。

Answer 1

如果我的问题没错，您可以使用graph_from_data_frame本身的igraph：

数据

d <- structure(list(voter     = c("ludraman", "blankfaze", "gzornenplatz", "orthogonal", 
                                  "andrevan", "texture"), 
                    user      = c("cjcurrie", "olivo", "cjcurrie", "olvion", "cerviz", "cjcurrie"), 
                    vote      = c(1L, -1L, 1L, 1L, 1L, 1L)), 
                    row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"), class = "data.frame")

图形

library(igraph)
g <- graph_from_data_frame(d)
plot(g)

您可能可以使用tehre（给出完整的数据）来使用可视化中数据的其他部分（例如得分）。

Answer 2

此解决方案适用于我的问题：

edge_list <- training_edges[df].                # create a edge list
G <- graph.data.frame(edge_list, directed=TRUE) # create the graph

A <- as_adjacency_matrix(G,type="both",names=TRUE,
sparse=FALSE, attr = "vote")                    # create the adjacency matrix

其中A是邻接矩阵。