高斯过程回归置信区间的估计

时间:2019-03-02 00:16:01

标签: scikit-learn statistics regression gaussian gpflow

这可能是一个奇怪的问题,但是当高斯过程回归看到大量嘈杂的数据而没有太多信号时,它们怎么办?下面,我收集了大量噪声数据,并运行两种不同的GPR实现,它们均产生极小的置信区间。为什么是这种情况,有充分的理由吗?我的直觉告诉我,置信区间应该更大。 GPR对平均值的估计真的那么有信心吗?另外,除了添加白噪声核外,是否有适当的方法来填充方差估计?

import numpy as np
import gpflow as gpflow
from sklearn.gaussian_process import GaussianProcessRegressor
from sklearn.gaussian_process.kernels import DotProduct, WhiteKernel, Matern, RBF

## some data
X1 = np.array([ 2.,  2.,  3.,  4.,  5.,  5.,  5.,  6.,  6.,  6.,  7.,  7.,  7.,
        8.,  8.,  8.,  8.,  8.,  9.,  9.,  9.,  9., 10., 11., 11., 12.,
       12., 12., 13., 13., 14., 14., 15., 15., 15., 16.])

Y1  = np.array([-0.70007257, -0.69388464, -0.63062014, -0.72834303, -0.67526754,
        1.00259286, -0.96141351, -0.08295884,  1.0727982 , -2.29816347,
       -0.61594418,  1.13696593, -2.18716473, -0.35037363,  1.96273672,
        1.31621059, -1.88566144,  1.80466116, -0.79665828,  2.40720146,
        1.83116473, -1.67224082, -0.96766061, -0.67430408,  1.79624005,
       -1.41192248,  1.01754167,  0.37327703, -1.1195072 ,  0.71855107,
       -1.16906878,  0.99336417,  1.12563488, -0.36836713,  0.12574823,
        0.23294988])

## gpflow
model = gpflow.models.GPR(X=X1[:,None],
                         Y= Y1[:,None], kern=gpflow.kernels.RBF(1))

gpflow.train.ScipyOptimizer().minimize(model)

## scikit
kernel = RBF()
gpr = GaussianProcessRegressor(kernel=kernel,
        random_state=0).fit(X= X1[:,None], y= Y1[:, None])

# plot function
def plot(m,  gpflow =True):
    plt.figure(figsize=(8, 4))
    xtest = np.linspace(np.min(X1),np.max(X1), 20)[:,None]
    line, = plt.plot(X1, Y1, 'x', mew=2)

    if gpflow:
        mu, var = m.predict_f(np.hstack((xtest, np.zeros_like(xtest))))

        plt.plot(xtest, mu, color="green", lw=2, label="GPflow")
        plt.fill_between(xtest[:, 0], 
                         (mu - 2*np.sqrt(var))[:, 0], 
                         (mu + 2*np.sqrt(var))[:, 0], 
                         color="lightgreen", alpha=0.4)
    else:   
        mu, se = m.predict(xtest, return_std=True)

        plt.plot(xtest, mu, color="red", lw=2, label="Scipy")
        plt.fill_between(xtest[:, 0], 
                         (mu - 2*se)[:, 0], 
                         (mu + 2*se)[:, 0], 
                         color="red", alpha=0.4)


    plt.legend()

Gpflow estimates

[Scipy estimates[2]

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

查看模型超参数的实际优化值通常很有帮助-在这种情况下,噪声方差,内核方差和内核长度标度:

                             class           ...                             value
GPR/kern/lengthscales    Parameter           ...                3.7149993613788737
GPR/kern/variance        Parameter           ...            2.0572871322469534e-06
GPR/likelihood/variance  Parameter           ...                1.5461369937869296

因此,GP将所有内容解释为噪声(在这种情况下,长度标尺的实际值非常任意,重要的是微小的内核差异)。 (如果使用predict_y而不是predict_f,则应该获得覆盖大部分观察值的置信区间。)“ RBF”(我更喜欢平方指数-每个固定核都描述径向基函数...)核对以前的功能(而且这仅使用超参数的最大似然点估计值),因此从这个意义上讲没有太大的灵活性-一旦您解释完所有数据,GP在某种意义上就是“说”没有信号,因此您得到了先验后验-均值为零。这有帮助吗?