使用GRanges时将UpSet交会图移至Mb

Question

我想将UpSetR的示例与GRanges一起使用。它工作正常。但是，将更多信息显示在Mb而非bp中。

library(circlize)
library(GenomicRanges)
lt2 = lapply(1:4, function(i) generateRandomBed())
lt2 = lapply(lt2, function(df) GRanges(seqnames = df[, 1], 
    ranges = IRanges(df[, 2], df[, 3])))
names(lt2) = letters[1:4]
m = make_comb_mat(lt2)
set_size(m)
UpSet(m)

我试图修改m对象和Granges来实现这一点，但是我没有成功。

width(lt2) <- width(lt2)/1000000

  

width<-（*tmp*中的错误，值= new（“ CompressedNumericList”，   elementType =“ numeric”，：替换“值”不是   具有与'x'相同的elementNROWS的IntegerList

set_size(m) <- set_size(m)/1000000

  

set_size（m）<-set_size（m）/ 1e + 06中的错误：找不到函数   “ set_size <-”

有什么想法可以完成吗？