Question

我正在使用igraph的R实现。我不明白为什么get_diamenter()返回一个igraph.vs对象，而shortest_paths()$vpath返回一个list对象。我试图绘制两个节点之间的最短路径。我可以画出网络直径

diam <- get_diameter(net_vc, directed=F)
vcol <- rep("gray40", vcount(net_vc))
vcol[diam] <- "gold"

但是我不能以类似的方式绘制最短路径：

sp = shortest_paths(net_vc, from=V(net_vc)$Name=="I0", to=V(net_vc)$Name=="I11")
sp <- sp$vpath
vcol <- rep("gray40", vcount(net_vc))
vcol[sp] <- "gold"

它返回： Error in vcol[sp] <- "gold" : invalid subscript type 'list'

如何将这个列表转换为顶点序列，以便as.vector(sp)返回顶点的位置，以便索引vcol？

Answer 1

get_diameter的文档说：

get_diameter返回具有实际直径的路径。如果有直径长度的许多最短路径，然后返回找到第一个。

因此它返回一个路径。另一方面，shortest_paths允许包含to个顶点的 list 。它将返回最短路径列表，igraph.vs列表，to列表中的每个顶点。即使您在shortest_paths中使用单个顶点调用to，也会获得一个列表。因此，要以所需的方式设置颜色，您需要引用列表的第一个（也是唯一一个）元素。您需要：

sp = shortest_paths(net_vc, from=V(net_vc)$Name=="I0", to=V(net_vc)$Name=="I11")
sp <- sp$vpath[[1]]
vcol <- rep("gray40", vcount(net_vc))
vcol[sp] <- "gold"

igraph：将列表转换为顶点序列

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