我有一个奇怪的问题:考虑容器化工作流的情况,其中整个工作流是使用单个奇异容器执行的。 这仍然需要python在系统上可用才能调用snakemake --use-singularity,对吗? 我怎样才能摆脱这种依赖呢?我可以在容器中安装python,snakemake和奇异性并执行
singularity exec my-container snakemake --use-singularity
使用集群配置安全吗?
编辑:似乎根本不起作用-我无法从另一个容器中获得具有奇异性的snakemake ...