使用dplyr mutate在RMarkdown for PDF中的ExtraKable阴影表?

时间:2019-02-22 22:08:24

标签: r dplyr r-markdown mutate kableextra

我想基于不同的值集对表应用不同的颜色底纹。我正在使用kableExtra在Rmarkdown中创建此表。我希望0和<.10之间的值保持不变。值> =。10和<.20阴影为黄色。值> =。20则显示为红色。

  df
  name    category 1    categry 2    category a   category b
  ab          .01         .45           .19          .09
  410         .12         .01           .05          .66
  NW 5th      .25         .22           .01          .16

这就是我用来制作现有表格的原因:

 library(knitr)
 library(dplyr)

 kable(df, caption = "warning values", digits = 2, format = "latex", 
 booktabs = T)%>%
 kable_styling(latex_options = c("striped"))%>%
 landscape()%>%
 row_spec(0, angle = 45)

我不确定如何使用mutate和cel_spec函数将其应用于整个表。表列和行名随每个报表fyi动态变化。

编辑:马丁的答案很好。直到我尝试清理我的电话号码。我的实际输入文件有更多数字,例如Martin的答案。它还具有包含下划线的文件名和行名。 (这在使用此答案时引起了问题,但我找到了解决方法。)

 #replace any "_" with escaped "\\_" for magrittR/latex compatability
 names(df) <- gsub(x = names(df), pattern = "\\_", replacement = 
 "\\\\_") 
 df$name <- gsub('\\_', '\\\\_', df$name)

 #format numbers
 df <- format(df, digits=0, nsmall=3, scientific = FALSE)

替换工作正常,其数字格式破坏了答案。一切仍然可以正常执行,但是我丢失了彩色表。 有想法吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

这是执行此操作的方法。注意,我使用了magrittr的compund赋值运算符。

---
title: test
output: pdf_document
---

```{r, echo = F, warning = F, message = F}
library(knitr)
library(dplyr)
library(kableExtra)
library(magrittr)
df <- data.frame(A = runif(4, 0, 1), B = runif(4, 0, 1), row.names = letters[1:4])

paint <- function(x) {  # our painting function
  ifelse(x < 0.1, "white", ifelse(x < 0.2, "yellow", "red"))
}

df %<>%. # compound assignment operator
  mutate_if(is.numeric, function(x) {  # conditional mutation, if the column type is numeric
   cell_spec(x, background = paint(x), format = "latex") 
  })

kable(df, caption = "warning values", digits = 2, format = "latex", 
      booktabs = T, escape = F) %>%
  landscape()%>%
  row_spec(0, angle = 45)
```

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