来自原子和键列表的分子的2D和/或3D图

Question

我有一个ID和位置（x，y，z）的原子列表，以及两个原子的ID结合在一起的键的列表。在Julia中创建此分子的2D和/或3D图形的最佳方法是什么？

Answer 1

看到同时具有节点（原子）和边缘（原子之间的边界）的列表，请考虑将您的分子表示为图形，并使用LightGraph.jl中可用的方法可视化graph。

2D和3D表示都是可能的。

Answer 2

您可以尝试使用xyz2graph软件包。