具有多个功能的大型数据集的动态时间规整(DTW)

时间:2019-02-14 21:33:54

标签: python hierarchical-clustering dtw

我是DTW的新手,正尝试将其应用于具有约700,000行和9个特征的数据集。我有两个形式的数组(矩阵),

[
   [0 1 0 0 0 0 0 0 0],
   [0 0 0 0 1 0 0 0 0],
   ...
   [0 0 0 0 0 0 1 0 0],
   [0 0 1 0 0 0 0 0 0],
]

我已经探索了fastdtwdtaidistance软件包。 “ fastdtw”能够在大约5分钟内给出上述矩阵的输出距离。此外,我还希望将结果可视化,并应用分层聚类。我没有在fastdtw中找到任何功能来可视化路径/结果以及进行聚类。

dtaidistance确实提供了这些功能,但是运行时间太长(我在上面的两个系列中都运行过它,它在15-20分钟后仍在运行)。有什么办法可以解决这个问题?还是可以对fastdtw的结果进行聚类和可视化?

非常感谢您提供帮助。

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