标签: python pandas google-cloud-datalab plink
我试图弄清楚如何在GC Datalab笔记本中使用pandas-plink读取plink文件。
pandas-plink
pandas-plink需要一个变量,该变量包含3个plink文件的路径/前缀。 (file_prefix.bim,file_prefix.fam,file_prefix.bed)
file_prefix.bim
file_prefix.fam
file_prefix.bed
from pandas_plink import read_plink (bim, fam, bed) = read_plink(gs://path/file_prefix)