想象一个mxn
数组a
和一个1xn
数组b
,我们想从b
中减去a
,这样{{从b
的第一个元素中减去1}},然后从a
中减去最大值0和b-a[0]
,依此类推...
所以:
a[1]
所以我们想得到:x = np.array([1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10])
a = np.repeat(x, 100000).reshape(10, 100000)
b = np.repeat(np.array([5]), 100000).reshape(1, 100000)
,重复100,000次。
我已经管理了下面的函数,该函数可以提供所需的结果:
[ 0, 0, 1, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10]
但是,它还没有完全向量化。所以:
def func(a, b):
n = np.copy(a)
m = np.copy(b)
for i in range(len(n)):
n[i] = np.where(n[i] >= m, n[i] - m, 0)
m = np.maximum(0, m - a[i])
if not m.any():
return n
return n
理想情况下,我想摆脱for循环,并使其尽可能地矢量化。
谢谢。
答案 0 :(得分:0)
我认为您可以将功能向量化:
import numpy as np
def func_vec(a, b):
ar = np.roll(a, 1, axis=0)
ar[0] = 0
ac = np.cumsum(ar, axis=0)
bc = np.maximum(b - ac, 0)
return np.maximum(a - bc, 0)
快速测试:
import numpy as np
def func(a, b):
n = np.copy(a)
m = np.copy(b)
for i in range(len(n)):
n[i] = np.where(n[i] >= m, n[i] - m, 0)
m = np.maximum(0, m - a[i])
if not m.any():
return n
return n
np.random.seed(100)
n = 100000
m = 10
num_max = 100
a = np.random.randint(num_max, size=(m, n))
b = np.random.randint(num_max, size=(1, n))
print(np.all(func(a, b) == func_vec(a, b)))
# True
但是,与矢量化算法相比,您的算法具有一个重要优势,那就是当发现没有其他可减去的内容时,它将停止迭代。这意味着,根据问题的大小和特定值(确定提前停止发生的时间,如果确定的话),矢量化的解决方案实际上可能会变慢。请参阅上面的示例:
%timeit func(a, b)
# 5.09 ms ± 78.5 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
%timeit func_vec(a, b)
# 12.4 ms ± 939 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
但是,您可以使用Numba获得“两全其美”的解决方案:
import numpy as np
import numba as nb
@nb.njit
def func_nb(a, b):
n = np.copy(a)
m = np.copy(b)
zero = np.array(0, dtype=a.dtype)
for i in range(len(n)):
n[i] = np.maximum(n[i] - m, zero)
m = np.maximum(zero, m - a[i])
if not m.any():
return n
return n
print(np.all(func(a, b) == func_nb(a, b)))
# True
%timeit func_nb(a, b)
# 3.36 ms ± 461 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)