如何正确使用cmd.transform_selection（）

Question

我有一组3x3旋转矩阵和一组用于配体姿势的相应翻译载体。我一直在尝试实现一种python方法，在该方法中，将姿势转换为它的原点，应用旋转矩阵之一，将姿势转换为它的原始位置，然后应用转换向量。目前，我一直在尝试实现PyMOL API命令：sort(doubles, c); ，该命令需要一个选择和一个cmd.transform_selection() PyMOL矩阵（https://pymolwiki.org/index.php/Transform_selection）。

我当前的方法如下：

1。）从原始姿势（"ttt"），我使用ProDy函数获取坐标（orig_pose）。

2。）我计算中心； org_coords，其中center是center = np.mean(org_coords, axis=0)矩阵。

3。）然后，我将[x, y, z]与cmd.translate()一起使用，将-center作为翻译向量。

4。）之后，我想应用我的旋转矩阵并将其格式化为orig_pose矩阵（例如'ttt'；请参见：https://pymolwiki.org/index.php/Transform_selection）。但是，似乎也对此姿势应用了翻译。

有没有人有使用此API命令的经验，或者遇到过给我输入（3x3旋转矩阵和转换向量）的对象转换对象的方法？非常感谢您的帮助，谢谢！