用重复的列名绑定两个数据框的行(按列名合并)

时间:2019-02-07 09:04:21

标签: r dataframe merge

我想按列名称绑定两个df的行,如果第二个df中不存在该列,则第一个应该具有NA。不幸的是dplyr::bind_rows的列名重复存在问题。您能帮我解决这个问题吗?

到目前为止我做了什么?

首先是一些可重现的数据:

df1 <- data.frame(replicate(6,sample(0:1,10,rep=TRUE)))
df2 <- data.frame(replicate(3,sample(0:1,10,rep=TRUE)))
colnames(df1) <- c('A','A','A','B','C','E')
colnames(df2) <- c('A','B','C')

df1
   A A A B C E
1  0 1 0 1 1 1
2  1 1 1 0 0 0
3  0 0 1 1 0 1
4  0 0 1 0 1 1
5  0 1 0 1 1 0
6  1 0 1 1 1 1
7  0 0 1 1 1 0
8  0 1 0 1 1 0
9  0 1 0 0 1 0
10 1 1 0 1 1 0

df2
   A B C
1  1 1 0
2  0 1 1
3  1 1 0
4  1 0 0
5  0 0 1
6  0 0 1
7  0 1 1
8  0 0 0
9  0 0 1
10 0 1 1

我想要得到什么?

   A A A B C E
1  0 1 0 1 1 1
2  1 1 1 0 0 0
3  0 0 1 1 0 1
4  0 0 1 0 1 1
5  0 1 0 1 1 0
6  1 0 1 1 1 1
7  0 0 1 1 1 0
8  0 1 0 1 1 0
9  0 1 0 0 1 0
10 1 1 0 1 1 0
11 1 1 1 1 0 NA
12 0 0 0 1 1 NA
13 1 1 1 1 0 NA
14 1 1 1 0 0 NA
15 0 0 0 0 1 NA
16 0 0 0 0 1 NA
17 0 0 0 1 1 NA
18 0 0 0 0 0 NA
19 0 0 0 0 1 NA
20 0 0 0 1 1 NA

我决定使用bind_rows中的dplyr,但是:

result <- bind_rows(mutate_all(df1, as.character), mutate_all(df2, as.character))
Error: Columns `A`, `A` must have unique names
Call `rlang::last_error()` to see a backtrace

谢谢您的帮助!

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

使用rbindlist中的data.table的选项

library(data.table)
cols <- names(df1)[names(df1) %in% names(df2)]
out <- setDF(rbindlist(list(df1, setNames(df2[cols], cols)), fill = TRUE))
out
#   A A A B C  E
#1  0 1 0 1 1  0
#2  1 1 1 0 1  0
#3  0 1 1 0 1  0
#4  0 0 1 0 1  0
#5  1 0 0 1 0  1
#6  1 1 1 1 0  1
#7  0 0 0 1 0  0
#8  0 0 0 1 0  0
#9  1 1 0 1 0  0
#10 0 1 0 1 1  0
#11 0 0 0 1 1 NA
#12 1 1 1 1 0 NA
#13 0 0 0 0 1 NA
#14 0 0 0 0 1 NA
#15 0 0 0 0 1 NA
#16 1 1 1 1 1 NA
#17 0 0 0 0 0 NA
#18 1 1 1 1 1 NA
#19 0 0 0 1 0 NA
#20 0 0 0 1 1 NA

df2[cols]部分将导致以下具有唯一名称的数据框

#   A A.1 A.2 B C
#1  0   0   0 1 1
#2  1   1   1 1 0
#3  0   0   0 0 1
# ...

这就是为什么我们调用setNames(df2[cols], cols)立即重命名列的原因。 setDF确保结果是data.frame而不是data.table


使用bind_rows只能得到四列

head(bind_rows(df1, setNames(df2[cols], cols)), 3)
#  A B C E
#1 1 1 0 0
#2 0 0 0 0
#3 0 0 1 1

答案 1 :(得分:1)

另一个选项可以将数据框转换为列表对象,然后使用cbind包中的cbind.fillrowrfill = NA

library(rowr)

new_df <- do.call(cbind.fill, c(mapply(c, as.list(df1),
         as.list(df2)[match(names(df1), names(df2))]), fill = NA))

但是这丢失了列名,您可以从df1中将其返回。

names(new_df) <-  names(df1)
new_df

#   A A A B C  E
#1  0 1 0 0 1  0
#2  0 1 0 0 0  0
#3  0 0 1 1 1  1
#4  0 0 1 0 1  0
#5  1 0 0 0 0  0
#6  0 0 1 0 1  1
#7  0 1 0 0 1  0
#8  0 1 0 0 0  0
#9  0 1 1 0 1  1
#10 1 1 1 0 1  1
#11 0 0 0 1 0 NA
#12 1 1 1 0 0 NA
#13 1 1 1 1 0 NA
#14 0 0 0 1 0 NA
#15 0 0 0 1 1 NA
#16 1 1 1 1 0 NA
#17 0 0 0 1 1 NA
#18 1 1 1 0 0 NA
#19 1 1 1 0 1 NA
#20 1 1 1 0 1 NA