我有一个16位图像数据集,我想从中创建GLCM矩阵以提取GLCM特征。
但是,结果矩阵显示一个值(如下图所示),我想知道为什么。
我尝试使用相同的图像但转换为8位,结果GLCM显示了多个值。
注意:我使用了以下Matlab函数:
glcm_matrix = graycomatrix(image.tif);
这是16位图像的裁剪样本:
注意:可以从here下载计算中使用的图像。原始图像对比度很低,看起来完全暗。上面显示的图像具有被拉伸的对比度,仅用于可视化目的。
编辑:
我用过
glcm_matrix = graycomatrix(image.tif, 'GrayLimits', []);
它给了我以下结果:
答案 0 :(得分:3)
这是一个装箱/缩放问题。
让我们来看看里面吧
edit graycomatrix
在这种情况下,我们对'NumLevels'和'GrayLimits'这两个选项很感兴趣
% 'NumLevels' An integer specifying the number of gray levels to use
% when scaling the grayscale values in I. For example,
% if 'NumLevels' is 8, GRAYCOMATRIX scales the values in
% I so they are integers between 1 and 8. The number of
% gray levels determines the size of the gray-level
% co-occurrence matrix (GLCM).
%
% 'NumLevels' must be an integer. 'NumLevels' must be 2
% if I is logical.
%
% Default: 8 for numeric
% 2 for logical
%
% 'GrayLimits' A two-element vector, [LOW HIGH], that specifies how
% the values in I are scaled into gray levels. If N is
% the number of gray levels (see parameter 'NumLevels')
% to use for scaling, the range [LOW HIGH] is divided
% into N equal width bins and values in a bin get mapped
% to a single gray level. Grayscale values less than or
% equal to LOW are scaled to 1. Grayscale values greater
% than or equal to HIGH are scaled to NumLevels. If
% 'GrayLimits' is set to [], GRAYCOMATRIX uses the
% minimum and maximum grayscale values in I as limits,
% [min(I(:)) max(I(:))].
因此,换句话说,该功能将您的数据分成8x8个bin,并假设缩放范围是整个uint16范围(0-65535)。但是,您提供的样本图像最小值为305,最大值为769,使其落入第一个bin中(0-8192左右)。当我打电话给A = graycomatrix(I)
时,会得到以下矩阵:
A =
6600 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0
但是,当调用A = graycomatrix(I,'GrayLimits', [])
时,缩放范围被视为min(I)-max(I),并且该函数按预期工作:
A =
4 2 1 0 0 0 0 0
1 1 2 2 0 0 0 0
2 2 4 7 1 0 0 0
0 1 7 142 72 1 0 0
0 0 0 65 1711 252 0 0
0 0 0 0 230 3055 178 0
0 0 0 0 0 178 654 8
0 0 0 0 0 0 8 9
在您的原始示例中,单个值最有可能在8x8矩阵的中间,因为您的原始图像是int16而不是uint16,因此Graycomatrix是对称的,以考虑负值的可能性。
您当然也可以缩放原始图像以适合其数据类型。例如,如果您预期有异常值等,百分位数缩放可能是个好主意。
答案 1 :(得分:2)
我只想基于@Tapio的出色答案。
在函数调用中使用名称/值对graycomatrix
时,GrayLimits', []
产生的GLCM看起来不错。但是,这种方法可能对您的应用程序无效。如果以此方式为一组图像计算GLCM,则对应于两个不同图像的两个不同GLCM的相同元素可能具有不同的含义。确实,由于对每个图像的强度进行了不同的缩放,因此GLCM的组件实际上在编码从一个图像到另一个图像的不同同时出现。
为避免这种情况,您可以首先计算整个图像数据集的最小和最大强度(例如minImgs
和maxImgs
),然后使用这些值重新缩放构成图像的所有图像的强度。以完全相同的方式处理数据集:
glcm_matrix = graycomatrix(image_tif, 'GrayLimits', [minImgs maxImgs]);