Question

我的输入：

Position   A   B   C   D   No
1   0   0   0   0   0
2   1   0   1   0   0
3   0   6   0   0   0
4   0   0   0   0   0
5   0   5   0   0   0

我有一个TSV文件，如上所述，我只希望对ABCD列中的数字行求和，而不是Position列。所需的输出将具有TSV，第一列为两行，位置和总和，

Position   Sum
1    0
2    2
3    6
4    0
5    5

到目前为止，我有：

awk 'BEGIN{print"Position\tSum"}{if(NR==1)next; sum=$2+$3+$4+$5 printf"%d\t%d\n",$sum}' infile.tsv > outfile.tsv

Answer 1

请您尝试一下，尝试对许多情况下不可用的字段编号进行硬编码，所以我采用了一种循环方法（在此方法中，我们先跳过第一个字段，然后取所有字段的总和）。 / p>

awk 'FNR==1{print $1,"sum";next} {for(i=2;i<NF;i++){sum+=$i};print $1,sum;sum=""}' Input_file

在需要以TAB格式输出的情况下，将awk更改为awk 'BEGIN{OFS="\t"}与代码相同。

Answer 2

您距离很近，请尝试以下操作：

 awk 'BEGIN{print"Position\tSum"}{if(NR==1)next; sum=$2+$3+$4+$5; printf "%d\t%d\n",$1,sum; }' infile.tsv > outfile.tsv

但是我说用换行符和空格更干净：

awk '
BEGIN { 
    print"Position\tSum";
}
{  
    if (NR==1) {
        next; 
    }
    sum = $2 + $3 + $4 + $5 + $6; 
    printf "%d\t%d\n", $1, sum;
}'

Answer 3

一个极简脚本可以是

$ awk '{print $1 "\t" (NR==1?"Sum":$2+$3+$4+$5)}' file

如何使用awk对tsv文件中的行求和？

3 个答案: