如何使用bash对文件中的每一列求和

时间:2013-02-19 11:23:47

标签: bash shell awk

我有以下格式的文件

id_1,1,0,2,3,lable1
id_2,3,2,2,1,lable1
id_3,5,1,7,6,lable1

我想要每列的总和(我有超过300列)

9,3,11,10,lable1 

我怎么能用bash做到这一点。 我尝试使用here描述的内容,但没有用。

5 个答案:

答案 0 :(得分:6)

使用awk

$ awk -F, '{for (i=2;i<NF;i++)a[i]+=$i}END{for (i=2;i<NF;i++) printf a[i]",";print $NF}' file
9,3,11,10,lable1

这将在逗号分隔文件中打印每列(来自i = 2 .. i = n-1)的总和,后跟最后一行中最后一列的值(即lable1)

答案 1 :(得分:1)

这是一个Perl单行:

<file perl -lanF, -E 'for ( 0 .. $#F ) { $sums{ $_ } += $F[ $_ ]; } END { say join ",", map { $sums{ $_ } } sort keys %sums; }'

它只会执行求和,因此示例中的第一列和最后一列将为0.

此版本将遵循您的示例输出:

<file perl -lanF, -E 'for ( 1 .. $#F - 1 ) { $sums{ $_ } += $F[ $_ ]; } END { $sums{ $#F } = $F[ -1 ]; say join ",", map { $sums{ $_ } } sort keys %sums; }'

答案 2 :(得分:1)

基于您链接的解决方案的修改版本:

#!/bin/bash

colnum=6
filename="temp"

for ((i=2;i<$colnum;++i))
do
  sum=$(cut -d ',' -f $i $filename | paste -sd+ | bc)
  echo -n $sum','
done
head -1 $filename | cut -d ',' -f $colnum

答案 3 :(得分:1)

如果总计需要按最后一列中的标签分组,您可以尝试这样做:

awk -F, '
  {
    L[$NF]
    for(i=2; i<NF; i++) T[$NF,i]+=$i
  }
  END{
    for(i in L){
      s=i
      for(j=NF-1; j>1; j--) s=T[i,j] FS s
      print s
    }
  }
' file

如果最后一列中的标签已排序,那么您可以尝试不使用数组并节省内存:

awk -F, '
  function labelsum(){
    s=p
    for(i=NF-1; i>1; i--) s=T[i] FS s
    print s
    split(x,T)
  }
  p!=$NF{
    if(p) labelsum()
    p=$NF
  }
  {
    for(i=2; i<NF; i++) T[i]+=$i
  }
  END {
    labelsum()
  }
' file

答案 4 :(得分:0)

Pure bash解决方案:

#!/usr/bin/bash


while IFS=, read -a arr
do
        for((i=1;i<${#arr[*]}-1;i++))
        do
                ((farr[$i]=${farr[$i]}+${arr[$i]}))
        done
        farr[$i]=${arr[$i]}
done < file
(IFS=,;echo "${farr[*]}")