Question

我正在尝试与Rshiny做一个热图。用户必须能够选择2个变量：时间和方向。取决于热图的变化。

当我确定时间和方向的值时，我的代码正在工作。当我尝试使用无功输入时，它不起作用。

错误消息是： .getReactiveEnvironment（）$ currentContext（）中的错误：没有活动的响应上下文，不允许进行操作。（您尝试做只能从反应式表达式或观察器内部完成的操作。）

JSd_inter是一个功能，如有需要，我可以向您显示。在第一个示例中，我使用“ T1” 固定了时间，并使用“ both” 进行了定向，这2个示例是我用来为热图创建数据框的2种不同方式。示例1工作，但我不能更改值，示例2不工作。在第3部分中，您可以找到我用来绘制热图的代码

idt <- as.vector(unique(data$contratid))
n= length(idt)
a <- matrix(0, n,n)
colnames(a) <- idt
rownames(a) <- idt
for (i in 1:n) {
  for (j in 1:n) {
   a[i,j] <- JSD_inter(data,20,"T1","both",idt[i],idt[j])


}}

第二个示例不起作用（即使我在函数中使用input $ timechoice而不是time（），它也仍然有效）

time <- reactive({input$timechoice})

direction<- reactive({input$dirchoice})

idt <- as.vector(unique(data$contratid))
n= length(idt)
a <- matrix(0, n,n)
colnames(a) <- idt
rownames(a) <- idt
for (i in 1:n) {
  for (j in 1:n) {
   a[i,j] <- JSD_inter(data,20,time(),direction(),idt[i],idt[j])


}}

第3部分/绘制热图的代码（因为示例1在起作用，我不认为问题来自这里）

reorder_cormat <- function(cormat){
  # Utiliser la corrélation entre les variables
  # comme mésure de distance
  dd <- as.dist((1-cormat)/2)
  hc <- hclust(dd)
  cormat <-cormat[hc$order, hc$order]
}

# Obtenir le triangle supérieur
get_upper_tri <- function(cormat){
  cormat[lower.tri(cormat)]<- NA
  return(cormat)
}

# Reorder correlation matrix
cormat <- reorder_cormat(a)
upper_tri <- get_upper_tri(cormat)
# Fondre la matrice de corrélation
melted_cormat <- melt(upper_tri, na.rm = TRUE)
# Créer un ggheatmap
ggheatmap <- ggplot(melted_cormat, aes(Var2, Var1, fill = value))+
  geom_tile(color = "white")+
  scale_fill_gradient2(low = "white", high = "red",  
                       midpoint = 0.09, limit = c(0,1), space = "Lab",
                       name="JSD") +
  theme_minimal()+ # minimal theme
  theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1, 
                                   size = 12, hjust = 1))+
  coord_fixed()

output$heat <- renderPlot(ggheatmap)

使用ui.R将我的shyniapp中的热图添加到代码中：

tabPanel（“ Heatmap”，plotOutput（“ heat”）），

如果需要更多信息，请告诉我

感谢您的时间

Answer 1

direction()和time()是反应性的。您不能在反应式上下文之外使用它们。

尝试一下：

myMatrix <- reactive({
  idt <- as.vector(unique(data$contratid))
  n= length(idt)
  a <- matrix(0, n,n)
  colnames(a) <- idt
  rownames(a) <- idt
  for (i in 1:n) {
    for (j in 1:n) {
     a[i,j] <- JSD_inter(data,20,time(),direction(),idt[i],idt[j])
    }
  }
  a
})

然后

melted_cormat <- reactive({
  cormat <- reorder_cormat(myMatrix())
  upper_tri <- get_upper_tri(cormat)
  melt(upper_tri, na.rm = TRUE)
})

最后，您必须在ggplot内执行renderPlot，因为它会调用melted_cormat()：

output$heat <- renderPlot({
  ggplot(melted_cormat(), aes(Var2, Var1, fill = value))+
    geom_tile(color = "white")+
    scale_fill_gradient2(low = "white", high = "red",  
                       midpoint = 0.09, limit = c(0,1), space = "Lab",
                       name="JSD") +
    theme_minimal()+ # minimal theme
    theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1, 
                                   size = 12, hjust = 1))+
    coord_fixed()
})

Rshiny，反应热图，无法更改变量

1 个答案: