我想基于分组的列和每个分组列中每个分组的阈值创建一列。
数据框如下:
df_in ->
unique_id myvalue identif
0 CTA15 19.0 TOP
1 CTA15 22.0 TOP
2 CTA15 28.0 TOP
3 CTA15 18.0 TOP
4 CTA15 22.4 TOP
5 AC007 2.0 TOP
6 AC007 2.3 SDME
7 AC007 2.0 SDME
8 AC007 5.0 SDME
9 AC007 3.0 SDME
10 AC007 31.4 SDME
11 AC007 4.4 SDME
12 CGT6 9.7 BTME
13 CGT6 44.5 BTME
14 TVF5 6.7 BTME
15 TVF5 9.1 BTME
16 TVF5 10.0 BTME
17 BGD1 1.0 BTME
18 BGD1 1.6 NON
19 GHB 51.0 NON
20 GHB 54.0 NON
21 GHB 4.7 NON
所以我根据'identif'列的每一组创建了一个字典:
md = {'TOP': 22, 'SDME': 10, 'BTME': 20, 'NON':20}
所以我的目标是根据以下条件创建一个新列,称为“ chk”:
如果“ identif”列与字典“ md”中的键匹配,并且该键的值大于“ =”,则大于“ myvalue”列中的对应值,则 我将有1,否则为0。
但是,我试图找到一种使用map / groupby / apply创建新输出数据框的好方法。我现在正在以一种非常低效的方式进行操作(这需要花费大量时间处理数百万行的真实数据) 使用如下功能:
def myfilter(df, idCol, valCol, mydict):
for index,row in df.iterrows():
for key, value in mydict.items():
if row[idCol] == key and row[valCol] >= value:
df['chk'] = 1
elif row[idCol] == key and row[valCol] < value:
df['chk'] = 0
return df
通过以下调用获取输出:
df_out = myfilter(df_in, 'identif', 'myvalue', md)
所以我的输出将是:
df_out ->
unique_id myvalue identif chk
0 CTA15 19.0 TOP 0
1 CTA15 22.0 TOP 1
2 CTA15 28.0 TOP 1
3 CTA15 18.0 TOP 0
4 CTA15 22.4 TOP 1
5 AC007 2.0 TOP 0
6 AC007 2.3 SDME 0
7 AC007 2.0 SDME 0
8 AC007 5.0 SDME 0
9 AC007 3.0 SDME 0
10 AC007 31.4 SDME 1
11 AC007 4.4 SDME 0
12 CGT6 9.7 BTME 0
13 CGT6 44.5 BTME 1
14 TVF5 6.7 BTME 0
15 TVF5 9.1 BTME 0
16 TVF5 10.0 BTME 0
17 BGD1 1.0 BTME 0
18 BGD1 1.6 NON 0
19 GHB 51.0 NON 1
20 GHB 54.0 NON 1
21 GHB 4.7 NON 0
此方法有效,但效率极低,并且想要一种更好的方法。
答案 0 :(得分:1)
首先,您遍历数据集总共四次,对于数据框中的每一行,您遍历字典中的每个元素。您可以更改功能以遍历一次。这样可以加快您的原始功能。尝试类似的东西:
def myfilter(df, idCol, valCol, mydict):
for index,row in df.iterrows():
value = mydict.get(row[idCol])
if row[valCol] >= value:
df['chk'] = 1
else:
df['chk'] = 0
return df
答案 1 :(得分:1)
这应该更快:
def func(identif, value):
if identif in md:
if value >= md[identif]:
return 1.0
else:
return 0.0
else:
return np.NaN
df['chk'] = df.apply(lambda row: func(row['identif'], row['myvalue']), axis=1)
这个小例子的时机:
CPU times: user 1.64 ms, sys: 73 µs, total: 1.71 ms
Wall time: 1.66 ms
您的版本计时:
CPU times: user 8.6 ms, sys: 1.92 ms, total: 10.5 ms
Wall time: 8.79 ms
尽管在这么小的例子中,这不是结论性的。