Question

我正在对数据集执行Kruskal-Wallis测试，并且尝试调整p值，但它似乎不起作用，这是我的代码：

> kruskal.test(df$Folate_biosynthesis, df$Group, p.adj="holm")

        Kruskal-Wallis rank sum test

data:  df$Folate_biosynthesis and df$Group Kruskal-Wallis chi-squared
= 8.5144, df = 5, p-value = 0.1301

> kruskal.test(df$Folate_biosynthesis, df$Group, p.adj="none")

        Kruskal-Wallis rank sum test

data:  df$Folate_biosynthesis and df$Group Kruskal-Wallis chi-squared
= 8.5144, df = 5, p-value = 0.1301

如您所见，如果我放p.adjust = "none"，我会得到完全相同的结果。怎么可能呢？
在此先感谢所有愿意提供帮助的人。安德里亚

Answer 1

当您有多个p值时，通常会进行p值调整。您只有一个p值，所以我想知道您希望调整在这里做什么。

话虽如此，它也没有出现p.adj的{{1}}参数。该函数具有点参数，但据我所知，它没有使用或将其传递给任何其他函数，因此，任何非命名参数的输入都将被忽略。

如果您要调整kruskal.test的多个输出中的p值，则可以将p值收集到一个向量中，然后使用适当的方法将其直接传递给kruskal.test。

但是，尽管如此，目前尚不清楚您希望实现什么目标-但是很显然，尝试在p.adjust中使用p.adj参数并不是实现目标的方法。< / p>

具有调整的p值的R的Kruskal-Wallis检验

1 个答案: