Question

我正在尝试创建一个代码，该代码使用k-mer遍历一串Text，并输出最常见的模式。（请注意，我也是初学者）。我正在使用Juptyer笔记本，每当我尝试运行代码时，都没有输出。（也许与Juptyer有关）？例如，假设我的文本是GATGATATAC，k-mer是3，那么我想输出最频繁的模式并将其显示为带有每个3字母模式词的频率的索引字典。

    def FrequentWords(Text, k):
        words = []
        freq = FrequencyMap(Text, k)
        m = max(freq.values())
        for key in freq:
            if freq[key] == m:
                words.append(key)
    Text = 'GATTACCGACGTATGCTACTCCGATACGATAT'
    k = 3
    return words

我不确定我应该在哪里定义Text和k，以便测试代码（这也可能是一个问题）。就像我说的那样，我正在使用Juptyer笔记本，当我按Run时，什么也没有发生。

Answer 1

我相信你的意思是

def FrequentWords(Text, k):
    words = []
    freq = FrequencyMap(Text, k)
    m = max(freq.values())
    for key in freq:
        if freq[key] == m:
            words.append(key)
    return words

Text = 'GATTACCGACGTATGCTACTCCGATACGATAT'
k = 3
FrequentWords(Text, k)

此外，您还可以通过列表理解来简化您的功能：

def FrequentWords(Text, k):
    freq = FrequencyMap(Text, k)
    m = max(freq.values())
    return [key for key in freq if freq[key] == m]

如何输出可从列表中找到最大频率值的字典？

1 个答案: