在Linux中将txt转换为biom格式

Question

我有一个包含多个txt文件的文件夹，我想应用for do do循环将它们从txt转换为biom文件，以下是我做了什么：

for txt in folder/*.txt
do biom convert -i $txt -o *.biom --to-hdf5
done

但是我有一个组合的biom文件。

如何修改上面的代码，将多个txt文件更改为biom文件，而不更改原始文件名？

like：test.txt至test.biom

Answer 1

以下应该可以解决问题（假设文件名中现在有空格）：

for txt in folder/*.txt
do biom convert -i $txt -o  ${txt%.txt}.biom --to-hdf5
done

bash替换${txt%.txt}去除了变量.txt，我们在末尾附加了.biom。