在同一Rmd文件下为pandoc和R重用代码块

时间:2019-01-10 15:34:49

标签: r-markdown pandoc

我已经编写了以下RMarkdown文件,该文件根据问题的克莱门特答案(pandoc doesn't text-wrap code blocks when converting to pdf)来显示正在使用的代码进行正确的行编号和换行以及显示代码的输出。 :

---
title: "Reuse code chunk"
output:
  pdf_document: 
    keep_tex: true
  html_notebook: default
editor_options:
  chunk_output_type: inline
header-includes:
  - \usepackage[T1]{fontenc}
  - \usepackage{times}
  - \usepackage{float}
  - \usepackage{booktabs}
  - \usepackage{fvextra} # https://stackoverflow.com/questions/20788464/pandoc-doesnt-text-wrap-code-blocks-when-converting-to-pdf
  - \DefineVerbatimEnvironment{Highlighting}{Verbatim}{breaklines,commandchars=\\\{\}}
---

```{r setup, include=TRUE, message=FALSE}
library(knitr)
library(dplyr)
```

<!-- https://stackoverflow.com/questions/22329685/how-to-display-line-numbers-in-rmarkdown-html-and-pdf/25299194#25299194 -->
```{#code_section .R .numberLines}  
data(iris) 

# Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit. Aenean commodo ligula eget dolor. Aenean massa. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Donec quam felis, ultricies nec, pellentesque eu, pretium quis, sem. Nulla consequat massa quis enim. Donec pede justo, fringilla vel, aliquet nec, vulputate eget, arcu. In enim justo, rhoncus ut, imperdiet a, venenatis vitae, justo. Nullam dictum felis eu pede mollis pretium. Integer tincidunt. Cras dapibus. Vivamus elementum semper nisi. Aenean vulputate eleifend tellus. Aenean leo ligula, porttitor eu, consequat vitae, eleifend ac, enim. Aliquam lorem ante, dapibus in, viverra quis, feugiat a, tellus. Phasellus viverra nulla ut metus varius laoreet. Quisque rutrum. Aenean imperdiet. Etiam ultricies nisi vel augue. Curabitur ullamcorper ultricies nisi. Nam eget dui. Etiam rhoncus. Maecenas tempus, tellus eget condimentum rhoncus, sem quam semper libero, sit amet adipiscing sem neque sed ipsum. Nam quam nunc, blandit vel, luctus pulvinar, hendrerit id, lorem. Maecenas nec odio et ante tincidunt tempus. Donec vitae sapien ut libero venenatis faucibus. Nullam quis ante. Etiam sit amet orci eget eros faucibus tincidunt. Duis leo. Sed fringilla mauris sit amet nibh. Donec sodales sagittis magna. Sed consequat, leo eget bibendum sodales, augue velit cursus nunc,
```

```{r code_section, echo=FALSE}
data(iris) 
iris %>%
  head %>%
  kable(.,format = 'latex',booktabs=TRUE,linesep='')

# Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit. Aenean commodo ligula eget dolor. Aenean massa. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Donec quam felis, ultricies nec, pellentesque eu, pretium quis, sem. Nulla consequat massa quis enim. Donec pede justo, fringilla vel, aliquet nec, vulputate eget, arcu. In enim justo, rhoncus ut, imperdiet a, venenatis vitae, justo. Nullam dictum felis eu pede mollis pretium. Integer tincidunt. Cras dapibus. Vivamus elementum semper nisi. Aenean vulputate eleifend tellus. Aenean leo ligula, porttitor eu, consequat vitae, eleifend ac, enim. Aliquam lorem ante, dapibus in, viverra quis, feugiat a, tellus. Phasellus viverra nulla ut metus varius laoreet. Quisque rutrum. Aenean imperdiet. Etiam ultricies nisi vel augue. Curabitur ullamcorper ultricies nisi. Nam eget dui. Etiam rhoncus. Maecenas tempus, tellus eget condimentum rhoncus, sem quam semper libero, sit amet adipiscing sem neque sed ipsum. Nam quam nunc, blandit vel, luctus pulvinar, hendrerit id, lorem. Maecenas nec odio et ante tincidunt tempus. Donec vitae sapien ut libero venenatis faucibus. Nullam quis ante. Etiam sit amet orci eget eros faucibus tincidunt. Duis leo. Sed fringilla mauris sit amet nibh. Donec sodales sagittis magna. Sed consequat, leo eget bibendum sodales, augue velit cursus nunc,
```

您可以看到在pandoc块和R代码块中都重复了相同的块,我认为手动重复该块效率不高,我可以以某种方式在R / pandoc中重用代码块,然后再次使用它(在pandoc和R)。

谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我建议对源代码使用knitr钩子(请参见https://yihui.name/knitr/hooks/),该钩子返回所需的markdown字符串。

---
title: "Reuse code chunk"
output:
  pdf_document: 
    keep_tex: true
  html_notebook: default
editor_options:
  chunk_output_type: inline
header-includes:
  - \usepackage[T1]{fontenc}
  - \usepackage{times}
  - \usepackage{float}
  - \usepackage{booktabs}
  - \usepackage{fvextra} # https://stackoverflow.com/questions/20788464/pandoc-doesnt-text-wrap-code-blocks-when-converting-to-pdf
  - \DefineVerbatimEnvironment{Highlighting}{Verbatim}{breaklines,commandchars=\\\{\}}
---

```{r setup, echo=FALSE}
knitr::knit_hooks$set(source = function(x, options) {
  paste(
    collapse = '\n',
    c(
      sprintf('\n\n```{#%s .%s .numberLines}', options$label, options$engine), 
      x, 
      '```\n\n'
    )
  )
})
```

```{r pkgs, include=TRUE, message=FALSE}
library(knitr)
library(dplyr)
```

```{r code_section}
data(iris) 
iris %>%
  head %>%
  kable(.,format = 'latex',booktabs=TRUE,linesep='')

# Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit. Aenean commodo ligula eget dolor. Aenean massa. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Donec quam felis, ultricies nec, pellentesque eu, pretium quis, sem. Nulla consequat massa quis enim. Donec pede justo, fringilla vel, aliquet nec, vulputate eget, arcu. In enim justo, rhoncus ut, imperdiet a, venenatis vitae, justo. Nullam dictum felis eu pede mollis pretium. Integer tincidunt. Cras dapibus. Vivamus elementum semper nisi. Aenean vulputate eleifend tellus. Aenean leo ligula, porttitor eu, consequat vitae, eleifend ac, enim. Aliquam lorem ante, dapibus in, viverra quis, feugiat a, tellus. Phasellus viverra nulla ut metus varius laoreet. Quisque rutrum. Aenean imperdiet. Etiam ultricies nisi vel augue. Curabitur ullamcorper ultricies nisi. Nam eget dui. Etiam rhoncus. Maecenas tempus, tellus eget condimentum rhoncus, sem quam semper libero, sit amet adipiscing sem neque sed ipsum. Nam quam nunc, blandit vel, luctus pulvinar, hendrerit id, lorem. Maecenas nec odio et ante tincidunt tempus. Donec vitae sapien ut libero venenatis faucibus. Nullam quis ante. Etiam sit amet orci eget eros faucibus tincidunt. Duis leo. Sed fringilla mauris sit amet nibh. Donec sodales sagittis magna. Sed consequat, leo eget bibendum sodales, augue velit cursus nunc,
```