我正在尝试为CNN模型实现自定义损失功能。我发现一个IPython notebook实现了名为Dice的自定义损失函数,如下所示:
from keras import backend as K
smooth = 1.
def dice_coef(y_true, y_pred, smooth=1):
intersection = K.sum(y_true * y_pred, axis=[1,2,3])
union = K.sum(y_true, axis=[1,2,3]) + K.sum(y_pred, axis=[1,2,3])
return K.mean( (2. * intersection + smooth) / (union + smooth), axis=0)
def bce_dice(y_true, y_pred):
return binary_crossentropy(y_true, y_pred)-K.log(dice_coef(y_true, y_pred))
def true_positive_rate(y_true, y_pred):
return K.sum(K.flatten(y_true)*K.flatten(K.round(y_pred)))/K.sum(y_true)
seg_model.compile(optimizer = 'adam',
loss = bce_dice,
metrics = ['binary_accuracy', dice_coef, true_positive_rate])
我以前从未使用过keras后端,并且确实对keras后端的矩阵计算感到困惑。因此,我创建了一些张量以查看代码中发生了什么:
val1 = np.arange(24).reshape((4, 6))
y_true = K.variable(value=val1)
val2 = np.arange(10,34).reshape((4, 6))
y_pred = K.variable(value=val2)
现在我运行dice_coef
函数:
result = K.eval(dice_coef(y_true=y_true, y_pred=y_pred))
print('result is:', result)
但是它给了我这个错误:
ValueError: Invalid reduction dimension 2 for input with 2 dimensions. for 'Sum_32' (op: 'Sum') with input shapes: [4,6], [3] and with computed input tensors: input[1] = <1 2 3>.
然后我将所有[1,2,3]
更改为-1
,如下所示:
def dice_coef(y_true, y_pred, smooth=1):
intersection = K.sum(y_true * y_pred, axis=-1)
# intersection = K.sum(y_true * y_pred, axis=[1,2,3])
# union = K.sum(y_true, axis=[1,2,3]) + K.sum(y_pred, axis=[1,2,3])
union = K.sum(y_true, axis=-1) + K.sum(y_pred, axis=-1)
return K.mean( (2. * intersection + smooth) / (union + smooth), axis=0)
现在它给了我一个价值。
result is: 14.7911625
问题:
[1,2,3]
? [1,2,3]
更改为-1
时,为什么代码可以工作?dice_coef
函数的作用是什么?答案 0 :(得分:1)
就像在numpy中一样,您可以定义要执行特定操作的轴。例如,对于4d数组,我们可以沿着这样的特定轴求和
>>> a = np.arange(150).reshape((2, 3, 5, 5))
>>> a.sum(axis=0).shape
(3, 5, 5)
>>> a.sum(axis=0, keepdims=True).shape
(1, 3, 5, 5)
>>> a.sum(axis=1, keepdims=True).shape
(2, 1, 5, 5)
如果我们输入一个元组,则可以沿多个轴执行此操作。
>>> a.sum(axis=(1, 2, 3), keepdims=True).shape
(2, 1, 1, 1)
如果参数为-1
,则默认为在最后一个轴上执行操作,而不管有多少个轴。
>>> a.sum(axis=-1, keepdims=True).shape
(2, 3, 5, 1)
这应该澄清点1和2。由于axis参数是(1, 2, 3)
,因此至少需要4个轴才能使操作有效。尝试将变量更改为val1 = np.arange(24).reshape((2, 2, 2, 3))
之类的东西,一切正常。
该模型似乎可以计算二进制交叉熵骰子损失,而dice_coeff()
可以计算出Dice coefficient。我不确定smooth
的目的是什么,但是如果它是为了避免被0除,那么您会期望会有一个很小的数字,例如1e-6。
答案 1 :(得分:1)
什么是[1,2,3]?
这些数字指定我们要进行求和的维度。最小的数字表示外部尺寸,最大的数字表示内部尺寸。参见示例:
import tensorflow as tf
tf.enable_eager_execution()
a = tf.constant([[[1, 2], [3, 4]], [[5, 6], [7, 8]]])
print(tf.reduce_sum(a, axis=2).numpy())
#[[ 3 7]
# [11 15]]
print(tf.reduce_sum(a, axis=1).numpy())
#[[ 4 6]
# [12 14]]
print(tf.reduce_sum(a, axis=0).numpy())
#[[ 6 8]
# [10 12]]
在上面的示例中,axis = 2
表示内部条目为:[1,2],[3,4],[5,6]和[7,8]。结果,求和后,我们有了张量:[[3, 7], [11, 15]]
。同样的想法也适用于其他轴。
当我将[1,2,3]更改为-1时,代码为何起作用
当我们没有指定任何轴或另一方面指定所有轴时,意味着我们对所有张量元素求和。结果我们的张量转换为单个标量。参见示例:
a = tf.constant([[[1, 2], [3, 4]], [[5, 6], [7, 8]]])
print(tf.reduce_sum(a).numpy()) # 36
print(tf.reduce_sum(a, axis=[0,1,2])) # 36
如果我们有3维[0,1,2],则axis = -1
等于axis = 2
。有关Python索引的完整教程,请参见here。
此dice_coef函数的作用是什么?
请参阅here,以获取有关dice_coef的完整说明。