cTAKES UmlsLookupAnnotator.xml在CDA文档的identifiedAnnotation中没有给出迹象/症状,疾病/障碍

时间:2019-01-10 09:55:05

标签: java nlp ctakes

我正在使用cTAKES对某些临床文件进行NLP研究,我一点都没有停留。

我创建了一个类似于AggregateCdaUMLSProcessor.xml的管道,其中我想使用dictionary_lookup UmlsLookupAnnotator.xml而不是DictionaryLookupAnnotatorUmls.xml

identifiedAnnotations给出的UmlsLookupAnnotator不包括Sign/SymptomsDisease/DisorderProcedure Mentions等。在Java中,我已经完成了sofaMapping的要求。该管道适用于纯文本文档,但没有为CDA提供上述注释。我已经使用AggregateCdaUMLSProcessor测试了CDA文档,它给出了上述注释(我也需要MedicationMention除外)。

如果有人可以给我任何有关我可以尝试或存在问题的建议,这将非常有帮助。

期待您的来信。

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