我正在使用cTAKES
对某些临床文件进行NLP研究,我一点都没有停留。
我创建了一个类似于AggregateCdaUMLSProcessor.xml
的管道,其中我想使用dictionary_lookup UmlsLookupAnnotator.xml
而不是DictionaryLookupAnnotatorUmls.xml
。
由identifiedAnnotations
给出的UmlsLookupAnnotator
不包括Sign/Symptoms
,Disease/Disorder
或Procedure Mentions
等。在Java中,我已经完成了sofaMapping
的要求。该管道适用于纯文本文档,但没有为CDA
提供上述注释。我已经使用AggregateCdaUMLSProcessor
测试了CDA文档,它给出了上述注释(我也需要MedicationMention除外)。
如果有人可以给我任何有关我可以尝试或存在问题的建议,这将非常有帮助。
期待您的来信。