使用dplyr在时间序列数据中用NA替换重复值

时间:2019-01-07 02:40:00

标签: r dplyr duplicates time-series na

我的数据似乎与其他类似的帖子有所不同。

box_num      date       x        y
1-Q      2018-11-18   20.2      8
1-Q      2018-11-25   21.23     7.2
1-Q      2018-12-2    21.23     23
98-L     2018-11-25   0.134     9.3
98-L     2018-12-2    0.134     4
76-GI    2018-12-2    22.734    4.562
76-GI    2018-12-9    28        4.562

在这里,我想将x和y列中的重复值替换为NA。 我尝试使用dplyr的代码:

(1)df <- df %>% group_by(box_num) %>% arrange(box_num,date) %>%
  mutate(df$x[duplicated(df$x),] <- NA)

它将创建一个具有所有NA的新列,而不是仅将重复的值替换为NA

 (2)df <- df %>% group_by(box_num) %>% arrange(box_num,date) %>%  
distinct(x,.keep_all = TRUE)

第二个只是给出了不重复的行(我们错过了时间序列) 所需的输出:

box_num      date       x        y
    1-Q      2018-11-18   20.2      8
    1-Q      2018-11-25   21.23     7.2
    1-Q      2018-12-2    NA        23
    98-L     2018-11-25   0.134     9.3
    98-L     2018-12-2    NA        4
    76-GI    2018-12-2    22.734    4.562
    76-GI    2018-12-9    28        NA

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

使用dplyr,我们可以group_by box_num并使用mutate_at xy列,并将duplicated的值替换为NA

library(dplyr)

df %>%
  group_by(box_num) %>%
  mutate_at(vars(x:y), funs(replace(., duplicated(.), NA)))


# box_num date          x     y
#  <fct>   <fct>      <dbl> <dbl>
#1 1-Q     2018-11-18 20.2    8   
#2 1-Q     2018-11-25 21.2    7.2 
#3 1-Q     2018-12-2  NA     23   
#4 98-L    2018-11-25  0.134  9.3 
#5 98-L    2018-12-2  NA      4   
#6 76-GI   2018-12-2  22.7    4.56
#7 76-GI   2018-12-9  28     NA  

R的基本选项(在这种情况下可能不是最好的)是:

cols <- c("x", "y")
df[cols] <- sapply(df[cols], function(x) 
            ave(x, df$box_num, FUN = function(x) replace(x, duplicated(x), NA)))

答案 1 :(得分:1)

这里是data.table的一个选项。将'data.frame'转换为'data.table'(setDT(df1),在.SDcols中指定感兴趣的列,replaceNA指定列中的重复元素,然后通过将输出分配回(:=)到列来更新这些列

library(data.table)
setDT(df1)[,  c('x', 'y') := lapply(.SD, function(x) 
     replace(x, anyDuplicated(x), NA)), box_num, .SDcols= x:y]
df1
#   box_num       date      x      y
#1:     1-Q 2018-11-18 20.200  8.000
#2:     1-Q 2018-11-25 21.230  7.200
#3:     1-Q  2018-12-2     NA 23.000
#4:    98-L 2018-11-25  0.134  9.300
#5:    98-L  2018-12-2     NA  4.000
#6:   76-GI  2018-12-2 22.734  4.562
#7:   76-GI  2018-12-9 28.000     NA

数据

df1 <- structure(list(box_num = c("1-Q", "1-Q", "1-Q", "98-L", "98-L", 
 "76-GI", "76-GI"), date = c("2018-11-18", "2018-11-25", "2018-12-2", 
"2018-11-25", "2018-12-2", "2018-12-2", "2018-12-9"), x = c(20.2, 
 21.23, 20.2, 0.134, 0.134, 22.734, 28), y = c(8, 7.2, 23, 9.3, 
 4, 4.562, 4.562)), class = "data.frame", 
 row.names = c(NA, -7L))