将本征库与cppyy

时间:2018-12-17 15:59:25

标签: python c++ eigen python-c-api

我已经成功地将cppyy用于正在处理的C ++项目的自动python绑定。我最近包含了Eigen库,但是在与cppyy一起使用时遇到了麻烦。有没有人有这样做的经验,或者知道我应该怎么做?

我对仓库有以下结构(仅显示相关部分):

.
├── CMakeLists.txt
├── build
├── external
   ── eigen
├── include
   ── all .hpp files
├── src
   ── all .cpp files
├── python
   ── qmc.py

这里external/eigenEigen GitHub repo的副本。 qmc.py文件是发生cppyy魔术的地方,它看起来像这样(在尝试添加Eigen之前,这很好用)

import cppyy
import tempfile
import os
import glob

try:
    current_dir = os.path.dirname(__file__)
except NameError:
    current_dir = os.getcwd()
source_dir = os.path.dirname(current_dir)
install_dir = os.path.join(source_dir, 'build')
include_dir = os.path.join(source_dir, 'include')
eigen_dir = os.path.join(source_dir, 'external', 'eigen')
print(current_dir, source_dir, include_dir, install_dir)

def cmake_run(build_type='Release', c_compiler='gcc', cxx_compiler='g++'):
    os.environ['CC'] = c_compiler
    os.environ['CXX'] = cxx_compiler
    os.system('cd {} && cmake {} -DCMAKE_BUILD_TYPE={}'.format(install_dir, source_dir, build_type))

def load_library():
    os.system('cd {} && make engine'.format(install_dir))
    libraries = glob.glob(os.path.join(install_dir, 'libengine.*'))
    print('Found libraries: {}'.format(libraries))
    library = libraries[0]
    cppyy.load_library(library)
    for header in glob.glob(os.path.join(include_dir, '*.hpp')):
        print('Loading {}'.format(header))
        cppyy.include(header)

构建部分有效,但是一旦我尝试加载使用Eigen的任何标头,就会出现错误。我已经尝试过几乎所有我能想到的东西(一个接一个地手动包含所需的标头,将整个库复制到构建目录等),但是无论我做什么,都会弹出相同类型的错误。

In file included from 
/path/to/repo/projects/include/myheader.hpp:3:10: fatal error: 'Eigen/Dense' file not found
#include <Eigen/Dense>
         ^~~~~~~~~~~~~

任何对此处更改内容的帮助将不胜感激!

编辑:为清楚起见,构建步骤可以正常进行,即代码可以按需编译,链接和运行。用cppyy加载库也可以。问题是cppyy还需要包含头文件。同样,这适用于我自己的标题,但找不到本征标题...

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

调用help()时,有:

>>> import cppyy
>>> help(cppyy)
    """
    add_include_path(path)
        Add a path to the include paths available to Cling.
    """
>>>

因此,eigen_dir是通往本征的路径,应该是凭单:

cppyy.add_include_path(eigen_dir)

但是,有更好的方法,因为您已经在使用cmake。查看此仓库:   https://github.com/jclay/cppyy-knearestneighbors-example。 这样,自动加载就可以了。即无需使用自己的代码处理库和标头。