Question

我正在R中的MuMin包中运行线性混合效果模型的挖矿，该模型很大（请参见下文）

>     Monster <- lmer(Fw.FratioFall ~ Average_mintemp_winter + (Average_mintemp_winter^2)
>                     + percentage_woody_coverage + (percentage_woody_coverage^2)
>                     + kmRoads.km2 + (kmRoads.km2^2) + Fracking 
>                     + WELLS_ACTIVED + (WELLS_ACTIVED^2) + BadlandsCoyote.1000_mi
>                     + (BadlandsCoyote.1000_mi^2) + cougar_presence + COYOTE_springsurveys
>                     + (COYOTE_springsurveys^2) + d3.1 + (d3.1^2) + WT_DEER_springsurveys
>                     + (WT_DEER_springsurveys^2) + WT_DEER_fallsurveys + (WT_DEER_fallsurveys^2) 
>                     + ELK_springsurveys + (ELK_springsurveys^2) + ELK_fallsurveys + (ELK_fallsurveys^2)     
>                     + (BadlandsCoyote.1000_mi*WELLS_ACTIVED) + (BadlandsCoyote.1000_mi*d3.1) 
>                     + (BadlandsCoyote.1000_mi*WELLS_ACTIVED*d3.1) 
>                     + (cougar_presence*percentage_woody_coverage) 
>                     + (COYOTE_springsurveys*WELLS_ACTIVED) 
>                     + (percentage_woody_coverage*cougar_presence*COYOTE_springsurveys)
>                     + (Average_mintemp_winter*COYOTE_springsurveys) 
>                     + (Average_mintemp_winter*BadlandsCoyote.1000_mi)
>                     + year + (1 | YEAR) + (year | StudyArea),  REML = F, data = mydata)

Dredge功能现在已经在i7处理器上运行了15个小时，我想知道这是否正常，对于这样大小的模型，我应该期望什么样的时间范围？

我已经检查了日志并且R hasnst崩溃了，挖泥机仍在运行（它正在大量生产“奇异拟合”模型）

singular fit
singular fit
singular fit
singular fit
singular fit
singular fit

我测试了一个较小的模型，并且挖泥功能花费了大约一分钟

更小模型

> sample <- lmer(Fw.FratioFall ~ Average_mintemp_winter +
> (Average_mintemp_winter^2)  + year + (1 | YEAR) + (year | StudyArea), 
> REML = F, data = mydata)

任何人都可以在使用MuMin包的模型挖泥机的时间框架上提出建议。谢谢。

Answer 1

正如一些评论者所说，疏通功能会根据要测试的模型数量增加其解析时间。建议是选择那些您认为应该具有最佳解释力的变量，您不应该“去钓鱼”模型，而是尝试生成最适合您的模型进行测试。

我尝试了一个包含 19 个变量的模型，估计解析时间为 79 分钟

MuMin套件-模型挖泥机仍在15小时后运行

1 个答案: